p5oU10-2 B638
Binärer Vektor mit Ubq10–EPSPS, für Dikotyle.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 570 | in UBQ10 |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 1.402 | in UBQ10 |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 1.786 | zwischen UBQ10 und cpt |
| PvuIICAG^CTG | 1.946 | in cpt |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 3.224 | in epsps |
| MluIA^CGCGT | 3.588 | zwischen epsps und TE9 |
| PstICTGCA^G | 3.898 | zwischen TE9 und RB |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 3.898 | zwischen TE9 und RB |
| NcoIC^CATGG | 3.924 | zwischen TE9 und RB |
| SpeIA^CTAGT | 3.937 | zwischen TE9 und RB |
| BamHIG^GATCC | 3.943 | zwischen TE9 und RB |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 3.951 | zwischen TE9 und RB |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 3.959 | zwischen TE9 und RB |
| HindIIIA^AGCTT | 3.967 | zwischen TE9 und RB |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 3.987 | zwischen TE9 und RB |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3.989 | zwischen TE9 und RB |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 4.010 | zwischen TE9 und RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 4.016 | zwischen TE9 und RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 4.048 | zwischen TE9 und RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 4.439 | zwischen RB und ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 8.653 | in pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 8.769 | in pVS1 |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 10.134 | in Sm/Sp |
Schneiden zweimal: EcoRI (969, 3.961), SalI (1.147, 3.979), SphI (3.904, 4.173), NdeI (5.554, 7.313), BglII (1.714, 3.999), ClaI (3.974, 8.849), SfiI (3.929, 3.993), FseI (6.320, 8.425), MfeI (14, 2.663), AgeI (9.263, 9.571).
Keine Schnittstelle: AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, BsrGI, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 1
- Ubq10
- Gen 1
- EPSPS
- Merkmale
- Dikotyle
- Weitere Marker
- Sm/Sp
- Größe
- 11.287 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 08-FEB-2016
Konstrukt
- UBQ10–cpt–EPSPS · TE9 · Kassette mit Insert, 309–3.888
- MCS · 13 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 3.898, 4.048
- SfiI ×2 · flankiert die MCS · Pos. 3.929, 3.993
- T-DNA-Grenzen (Borders) · LB, RB
Ligation of esps-Xho-Mlu* into B435p9oU10-LH*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| UBQ10 | Sonstiges misc_feature | 309 | 1.784 | 1.476 | + |
| Ubi cds 5 | Promotor misc_feature | 1.413 | 1.476 | 64 | + |
| int | Schnittstelle misc_feature | 1.479 | 1.782 | 304 | + |
| cpt | Kodierende Sequenz CDS | 1.804 | 2.022 | 219 | + |
| EPSPS | Kodierende Sequenz CDS | 2.023 | 2.556 | 534 | + |
| int | Schnittstelle misc_feature | 2.557 | 2.745 | 189 | + |
| epsps | Kodierende Sequenz CDS | 2.746 | 3.588 | 843 | + |
| TE9 | Terminator misc_feature | 3.598 | 3.888 | 291 | + |
| RB | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 4.064 | 4.087 | 24 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone misc_feature | 4.622 | 5.319 | 698 | + |
| bom | Origin / Backbone misc_feature | 5.356 | 5.615 | 260 | + |
| pVS1 | Origin / Backbone misc_feature | 5.868 | 9.573 | 3.706 | + |
| Sm/Sp | Selektionsmarker CDS | 9.757 | 10.767 | 1.011 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
p5oU10-2 (B638; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p5oU10-2)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.