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DNA Cloning Service
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Binäre Vektoren

p6D35s-mEGFP F476

Binärer Vektor mit 35s–hptII und mEGFP, für Dikotyle.

12345678''pVS1 ORI'''ParBstrep/spec'ColE1''Right Border RegionhptII'hptII''35SmEGFPmEGFP'E9OCSintST-LS1'LB'RBXbaI (163)XhoI (587)PstI, SbfI, NotI, SpeIBamHI, SmaI, BsrGI, EcoRIHindIII (2194)BstBI (2557)ClaI (2788)SalI, BsmBIAflII, BglII, ApaI, PmeISphI (3524)AatII (3790)F476p6D35s-mEGFP8.052 bp

GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq

Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.

Restriktionsschnittstellen

Single Cutter · SchnittstelleSchneidet beiLage
XbaIT^CTAGA163zwischen Left Border Region und 35S
XhoI (PaeR7I)C^TCGAG587zwischen 35S und Kozak
PstICTGCA^G2.130zwischen E9 und mEGFP
SbfI (SdaI)CCTGCA^GG2.130zwischen E9 und mEGFP
NotIGC^GGCCGC2.139zwischen E9 und mEGFP
SpeIA^CTAGT2.149zwischen E9 und mEGFP
BamHIG^GATCC2.158zwischen E9 und mEGFP
SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG2.169zwischen E9 und mEGFP
BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA2.176zwischen E9 und mEGFP
EcoRIG^AATTC2.185zwischen E9 und mEGFP
HindIIIA^AGCTT2.194zwischen E9 und mEGFP
BstBI (Bsp119I)TT^CGAA2.557in mEGFP
ClaI (BspDI)AT^CGAT2.788in mEGFP
SalIG^TCGAC3.127zwischen mEGFP und OCS
BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5)3.147in OCS
AflII (BspTI)C^TTAAG3.337zwischen OCS und Right Border Region
BglIIA^GATCT3.347zwischen OCS und Right Border Region
ApaI (PspOMI)GGGCC^C3.358zwischen OCS und Right Border Region
PmeI (MssI)GTTT^AAAC3.399in Right Border Region
SphI (PaeI)GCATG^C3.524in Right Border Region
AatII (ZraI)GACGT^C3.790in Right Border Region

Schneiden zweimal: KpnI (2.438, 3.367), EcoRV (494, 3.911), MluI (1.820, 2.200), SfiI (2.138, 3.341), EagI (2.139, 3.781), SacII (975, 1.805), PvuI (3.734, 7.423).

Keine Schnittstelle: SacI, NcoI, NdeI, NheI, AscI, PacI, FseI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, HpaI, NsiI, PvuII, BsaI, SapI, AarI.

Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.

Promotor 1
35s
Gen 1
hptII
Gen 2
mEGFP
Merkmale
Dikotyle
Weitere Marker
hptII'', strep/spec
Größe
8.052 bp, zirkulär
Datum des Eintrags
01-MAR-2023

Konstrukt

  • 35S–hptII · E9 · Selektionskassette, 169–2.120
  • MCS · 9 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 2.130, 2.194
  • SfiI ×2 · flankiert die MCS · Pos. 2.138, 3.341
  • T-DNA-Grenzen (Borders) · LB, RB

Ligation of E038pUbiAt-mEGFP* into D010p6D35s*

Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.

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Annotierte Elemente

ElementTypStartEndeLängeStrang
LB'T-DNA-Grenze (Border) misc_feature12424+
35SPromotor misc_feature169584416+
KozakSchnittstelle misc_feature6006045+
hptIISelektionsmarker CDS6051.174570+
intSchnittstelle misc_feature1.1751.363189+
'hptII''Selektionsmarker CDS1.3641.819456+
'E9Terminator misc_feature1.8302.120291+
mEGFPKodierende Sequenz CDS2.2172.595379+
ST-LS1'Sonstiges misc_feature2.5962.784189+
mEGFPKodierende Sequenz CDS2.7853.122338+
A206KSchnittstelle misc_feature3.0213.0233+
OCSTerminator misc_feature3.1323.327196+
Right Border RegionSonstiges misc_feature3.3703.972603+
RBT-DNA-Grenze (Border) misc_feature3.4153.43824+
'ColE1''Origin / Backbone misc_feature3.9864.644659+
''pVS1 ORI'''Origin / Backbone misc_feature4.6736.6361.964+
ParBKodierende Sequenz CDS4.9996.1741.176+
strep/specSelektionsmarker CDS6.8257.8351.011+
Left Border RegionT-DNA-Grenze (Border) misc_feature7.9031630+

PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle

Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.

Zitierweise

Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.

p6D35s-mEGFP (F476; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6D35s-mEGFP)

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