p6M2x35s-UbiZmGusXi C906
Binärer Vektor mit 2x35s–hptII und UbiZm–oGus, für Monokotyle.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2.508 | zwischen E9 und Ubi-int |
| NotIGC^GGCCGC | 2.517 | zwischen E9 und Ubi-int |
| SpeIA^CTAGT | 2.524 | zwischen E9 und Ubi-int |
| BamHIG^GATCC | 2.530 | zwischen E9 und Ubi-int |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 2.538 | zwischen E9 und Ubi-int |
| NcoIC^CATGG | 3.591 | in Intron |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 3.664 | in Intron |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 3.777 | in Intron |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 3.822 | in Intron |
| HindIIIA^AGCTT | 4.056 | zwischen Ubi-int und GusX' |
| MluIA^CGCGT | 4.062 | zwischen Ubi-int und GusX' |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 4.375 | in GusX' |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 4.419 | in GusX' |
| AarICACCTGC(4/8) | 4.870 | in 'Intron |
| SalIG^TCGAC | 6.080 | zwischen 'GusX und OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 6.100 | in OCS |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 6.322 | zwischen OCS und Right Border Region |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 6.354 | in Right Border Region |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 6.479 | in Right Border Region |
Schneiden zweimal: PstI (2.508, 4.050), XhoI (958, 3.244), BglII (3.491, 6.300), ApaI (3.604, 6.313), SfiI (2.516, 6.294), SacII (1.346, 2.176).
Keine Schnittstelle: EcoRI, SacI, AscI, PacI, FseI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, AflII, BsrGI, PvuII, SapI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 1
- 2x35s
- Gen 1
- hptII
- Promotor 2
- UbiZm
- Gen 2
- oGus
- Merkmale
- Monokotyle
- Weitere Marker
- hptII, strep/spec
- Größe
- 11.007 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 15-DEC-2022
Konstrukt
- P2x35s–hptII · E9 · Selektionskassette, 174–2.498
- Ubi-int–GusX · OCS · Kassette mit Insert, 2.546–6.280
- MCS · 5 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 2.508, 2.538
- SfiI ×2 · flankiert die Kassette Ubi-int–GusX · Pos. 2.516, 6.294
- T-DNA-Grenzen (Borders) · LB, RB
Ligation of C673pC119p6oAct-P4-oGusXi* into C242p6M2x35s-UbiZmGFP*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| LB' | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P2x35s' | Promotor misc_feature | 174 | 958 | 785 | + |
| Kozak | Schnittstelle misc_feature | 971 | 975 | 5 | + |
| hptII | Selektionsmarker CDS | 976 | 1.545 | 570 | + |
| int | Schnittstelle misc_feature | 1.546 | 1.734 | 189 | + |
| 'hptII | Selektionsmarker CDS | 1.735 | 2.190 | 456 | + |
| 'E9 | Terminator misc_feature | 2.208 | 2.498 | 291 | + |
| 'Ubi-int | Promotor misc_feature | 2.546 | 4.053 | 1.508 | + |
| Intron | Schnittstelle misc_feature | 3.532 | 4.051 | 520 | + |
| GusX' | Kodierende Sequenz CDS | 4.079 | 4.693 | 615 | + |
| ''Intron | Schnittstelle misc_feature | 4.694 | 4.882 | 189 | + |
| ''GusX | Kodierende Sequenz CDS | 4.883 | 6.079 | 1.197 | + |
| OCS | Terminator misc_feature | 6.085 | 6.280 | 196 | + |
| Right Border Region | Sonstiges misc_feature | 6.325 | 6.927 | 603 | + |
| RB | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 6.370 | 6.393 | 24 | + |
| 'ColE1'' | Origin / Backbone misc_feature | 6.941 | 7.599 | 659 | + |
| ''pVS1 ORI''' | Origin / Backbone misc_feature | 7.628 | 9.591 | 1.964 | + |
| strep/spec | Selektionsmarker CDS | 9.780 | 10.790 | 1.011 | + |
| Left Border Region | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 10.858 | 163 | 0 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
p6M2x35s-UbiZmGusXi (C906; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6M2x35s-UbiZmGusXi)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.