p6i-2x35s-TE9
Binärer Vektor mit 2x35s–hptII, für Monokotyle.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 55 | zwischen LB und P2x35s' |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 851 | zwischen P2x35s' und hpt |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 1.847 | in hpt |
| MluIA^CGCGT | 2.104 | zwischen hpt und E9 |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2.414 | zwischen E9 und RB |
| SpeIA^CTAGT | 2.453 | zwischen E9 und RB |
| BamHIG^GATCC | 2.459 | zwischen E9 und RB |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 2.475 | zwischen E9 und RB |
| HindIIIA^AGCTT | 2.483 | zwischen E9 und RB |
| SalIG^TCGAC | 2.495 | zwischen E9 und RB |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2.503 | zwischen E9 und RB |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2.505 | zwischen E9 und RB |
| BglIIA^GATCT | 2.515 | zwischen E9 und RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2.532 | zwischen E9 und RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 2.564 | zwischen E9 und RB |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 7.169 | in pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 7.285 | in pVS1 |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 8.650 | in Sm/Sp |
Schneiden zweimal: EcoRI (1.121, 2.477), PstI (1.215, 2.414), SphI (2.420, 2.689), SmaI (862, 2.467), NcoI (1.230, 2.440), ClaI (2.490, 7.365), EcoRV (719, 3.076), ApaI (860, 2.526), SfiI (2.445, 2.509), FseI (4.836, 6.941), MfeI (1.402, 9.817), AgeI (7.779, 8.087), AatII (905, 2.955), XmnI (354, 679), BsaI (7.688, 8.108), SapI (4.008, 7.905).
Keine Schnittstelle: SacI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, BsrGI, PvuII, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 1
- 2x35s
- Gen 1
- hptII
- Gen 2
- MCS
- Merkmale
- Monokotyle, hptII mit STLS1-Intron, SfiI-Klonierung
- Weitere Marker
- Sm/Sp
- Größe
- 10.051 bp, zirkulär
Konstrukt
- P2x35s–hpt · E9 · Selektionskassette, 67–2.404
- MCS · 11 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 2.414, 2.564
- SfiI ×2 · flankiert die MCS · Pos. 2.445, 2.509
- T-DNA-Grenzen (Borders) · LB, RB
Ligation of 2x35s-Xba-Xho* into 269p6i-TE9*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| P2x35s' | Promotor misc_feature | 67 | 851 | 785 | + |
| hpt | Selektionsmarker misc_feature | 878 | 1.295 | 418 | + |
| STLS1 | Sonstiges misc_feature | 1.296 | 1.484 | 189 | + |
| hpt | Selektionsmarker misc_feature | 1.485 | 2.092 | 608 | + |
| E9 | Terminator misc_feature | 2.114 | 2.404 | 291 | + |
| RB | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 2.580 | 2.603 | 24 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone misc_feature | 3.138 | 3.835 | 698 | + |
| pVS1 | Origin / Backbone misc_feature | 4.384 | 8.089 | 3.706 | + |
| Sm/Sp | Selektionsmarker CDS | 8.273 | 9.283 | 1.011 | + |
| LB | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 9.804 | 9.827 | 24 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
p6i-2x35s-TE9 (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6i-2x35s-TE9)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.
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