Zum Inhalt springen
DNA Cloning Service
DE

Binäre Vektoren

p6i-2x35s-TE9

Binärer Vektor mit 2x35s–hptII, für Monokotyle.

12345678910pVS1Sm/SpP2x35s'ColE1hpthptE9STLS1RBLBXbaI (55)XhoI (851)SacII (1847)MluI (2104)SbfI, SpeI, BamHI, NsiIHindIII, SalI, StuI, AflIIBglII, KpnI, PmeIBsiWI, NheIBstEII (8650)p6i-2x35s-TE910.051 bp

GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq

Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.

Restriktionsschnittstellen

Single Cutter · SchnittstelleSchneidet beiLage
XbaIT^CTAGA55zwischen LB und P2x35s'
XhoI (PaeR7I)C^TCGAG851zwischen P2x35s' und hpt
SacII (Cfr42I)CCGC^GG1.847in hpt
MluIA^CGCGT2.104zwischen hpt und E9
SbfI (SdaI)CCTGCA^GG2.414zwischen E9 und RB
SpeIA^CTAGT2.453zwischen E9 und RB
BamHIG^GATCC2.459zwischen E9 und RB
NsiI (Mph1103I)ATGCA^T2.475zwischen E9 und RB
HindIIIA^AGCTT2.483zwischen E9 und RB
SalIG^TCGAC2.495zwischen E9 und RB
StuI (Eco147I)AGG^CCT2.503zwischen E9 und RB
AflII (BspTI)C^TTAAG2.505zwischen E9 und RB
BglIIA^GATCT2.515zwischen E9 und RB
KpnI (Acc65I)GGTAC^C2.532zwischen E9 und RB
PmeI (MssI)GTTT^AAAC2.564zwischen E9 und RB
BsiWI (Pfl23II)C^GTACG7.169in pVS1
NheI (BmtI)G^CTAGC7.285in pVS1
BstEII (Eco91I)G^GTNACC8.650in Sm/Sp

Schneiden zweimal: EcoRI (1.121, 2.477), PstI (1.215, 2.414), SphI (2.420, 2.689), SmaI (862, 2.467), NcoI (1.230, 2.440), ClaI (2.490, 7.365), EcoRV (719, 3.076), ApaI (860, 2.526), SfiI (2.445, 2.509), FseI (4.836, 6.941), MfeI (1.402, 9.817), AgeI (7.779, 8.087), AatII (905, 2.955), XmnI (354, 679), BsaI (7.688, 8.108), SapI (4.008, 7.905).

Keine Schnittstelle: SacI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, BsrGI, PvuII, AarI.

Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.

Promotor 1
2x35s
Gen 1
hptII
Gen 2
MCS
Merkmale
Monokotyle, hptII mit STLS1-Intron, SfiI-Klonierung
Weitere Marker
Sm/Sp
Größe
10.051 bp, zirkulär

Konstrukt

  • P2x35s–hpt · E9 · Selektionskassette, 67–2.404
  • MCS · 11 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 2.414, 2.564
  • SfiI ×2 · flankiert die MCS · Pos. 2.445, 2.509
  • T-DNA-Grenzen (Borders) · LB, RB

Ligation of 2x35s-Xba-Xho* into 269p6i-TE9*

Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.

Annotierte Elemente

ElementTypStartEndeLängeStrang
P2x35s'Promotor misc_feature67851785+
hptSelektionsmarker misc_feature8781.295418+
STLS1Sonstiges misc_feature1.2961.484189+
hptSelektionsmarker misc_feature1.4852.092608+
E9Terminator misc_feature2.1142.404291+
RBT-DNA-Grenze (Border) misc_feature2.5802.60324+
ColE1Origin / Backbone misc_feature3.1383.835698+
pVS1Origin / Backbone misc_feature4.3848.0893.706+
Sm/SpSelektionsmarker CDS8.2739.2831.011+
LBT-DNA-Grenze (Border) misc_feature9.8049.82724+

PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle

Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.

Zitierweise

Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.

p6i-2x35s-TE9 (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6i-2x35s-TE9)

Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.

Verwendet in

Alle Publikationen