p6oAct-UbiZm-oGFPi-LH B616
Binärer Vektor mit Act–hptII und UbiZm–EGFP, für Monokotyle.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| AarICACCTGC(4/8) | 1.002 | in ACT |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 1.212 | in ACT |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 2.620 | in hptII |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2.634 | in hptII |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 3.270 | zwischen TE9 und UbiZm |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 3.311 | zwischen TE9 und UbiZm |
| SpeIA^CTAGT | 4.832 | zwischen UbiZm und link |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 4.846 | zwischen UbiZm und link |
| HindIIIA^AGCTT | 4.862 | zwischen UbiZm und link |
| MluIA^CGCGT | 4.868 | zwischen UbiZm und link |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 4.874 | zwischen UbiZm und link |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 5.271 | in gfpm |
| SalIG^TCGAC | 5.841 | zwischen gfpm und Tnos |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 5.888 | in Tnos |
| PacITTAAT^TAA | 6.153 | zwischen Tnos und RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 6.219 | zwischen Tnos und RB |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 6.731 | zwischen RB und ColE1 |
| BbsI (BpiI)GAAGAC(2/6) | 8.020 | zwischen ColE1 und pVS1 |
Schneiden zweimal: EcoRI (691, 4.856), BamHI (1.408, 4.838), KpnI (6.130, 6.187), XhoI (1.720, 4.022), NcoI (3.296, 4.369), ApaI (4.382, 6.181), SfiI (3.301, 6.164), BsiWI (3.318, 10.824), AgeI (11.434, 11.742), SacII (2.108, 2.938), AatII (6.137, 6.610), SapI (7.663, 11.560).
Keine Schnittstelle: AscI, AvrII, HpaI, PvuII.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 1
- Act
- Gen 1
- hptII
- Promotor 2
- UbiZm
- Gen 2
- EGFP
- Merkmale
- Monokotyle
- Weitere Marker
- Sm/Sp
- Größe
- 13.458 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 08-FEB-2016
Konstrukt
- ACT–hptII · TE9 · Selektionskassette, 313–3.260
- UbiZm–gfpm · Tnos · Kassette mit Insert, 3.324–6.112
- MCS · 5 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 4.832, 4.874
- SfiI ×2 · flankiert die Kassette UbiZm–gfpm · Pos. 3.301, 6.164
- T-DNA-Grenzen (Borders) · LB, RB
Ligation of GFP-Hind-Sal* into B615p6oAct-UbiZm-LH*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| ACT | Promotor misc_feature | 313 | 1.710 | 1.398 | + |
| hptII | Selektionsmarker CDS | 1.738 | 2.307 | 570 | + |
| int | Schnittstelle misc_feature | 2.308 | 2.496 | 189 | + |
| hptII | Selektionsmarker CDS | 2.497 | 2.952 | 456 | + |
| TE9 | Terminator misc_feature | 2.970 | 3.260 | 291 | + |
| UbiZm | Promotor misc_feature | 3.324 | 4.831 | 1.508 | + |
| int | Schnittstelle misc_feature | 4.310 | 4.829 | 520 | + |
| link | Sonstiges misc_feature | 4.880 | 4.930 | 51 | + |
| gfpm | Kodierende Sequenz CDS | 4.931 | 5.309 | 379 | + |
| int | Schnittstelle CDS | 5.310 | 5.498 | 189 | + |
| gfpm | Kodierende Sequenz CDS | 5.499 | 5.836 | 338 | + |
| Tnos | Terminator misc_feature | 5.859 | 6.112 | 254 | + |
| RB | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 6.235 | 6.258 | 24 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone misc_feature | 6.793 | 7.490 | 698 | + |
| pVS1 | Origin / Backbone misc_feature | 8.039 | 11.744 | 3.706 | + |
| Sm/Sp | Selektionsmarker CDS | 11.928 | 12.938 | 1.011 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
p6oAct-UbiZm-oGFPi-LH (B616; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6oAct-UbiZm-oGFPi-LH)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.