Binäre Vektoren · Mehrere Expressionskassetten
p7M2x35s-UbiZ-UbiZ H202
Binärer Vektor mit 2x35s–bar, für Monokotyle.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 1.057 | in Bar' |
| AarICACCTGC(4/8) | 1.499 | in 'Bar' |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2.036 | zwischen E9 und Ubi-int |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2.038 | zwischen E9 und Ubi-int |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 2.054 | zwischen E9 und Ubi-int |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 2.061 | zwischen E9 und Ubi-int |
| AscI (SgsI)GG^CGCGCC | 3.594 | zwischen Ubi-int und Thsp17 |
| AvrII (XmaJI)C^CTAGG | 5.349 | zwischen Ubi-int und T35S |
| MluIA^CGCGT | 5.361 | zwischen Ubi-int und T35S |
| NotIGC^GGCCGC | 5.578 | zwischen T35S und Right Border Region |
| PacITTAAT^TAA | 5.590 | zwischen T35S und Right Border Region |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 5.629 | zwischen T35S und Right Border Region |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 5.661 | in Right Border Region |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 5.786 | in Right Border Region |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 6.052 | in Right Border Region |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 9.464 | in strep/spec |
Schneiden zweimal: NcoI (3.112, 4.883), NheI (3.185, 4.956), ClaI (3.298, 5.069), EcoRV (826, 6.173), SfiI (2.044, 5.601), NsiI (3.343, 5.114), EagI (5.578, 6.043), SacII (1.599, 1.616), XmnI (461, 786).
Keine Schnittstelle: EcoRI, BamHI, HindIII, SalI, SacI, SmaI, SpeI, FseI, AgeI, BstBI, HpaI, AflII, BsrGI, PvuII, BsmBI, SapI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 1
- 2x35s
- Gen 1
- bar
- Promotor 2
- UbiZm
- Merkmale
- Monokotyle
- Weitere Marker
- Bar', 'Bar', strep/spec
- Größe
- 10.314 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 15-MAY-2026
Konstrukt
- P2x35s–Bar · E9 · Selektionskassette, 174–2.026
- Ubi-int–(leer)–Thsp17 · leere Expressionskassette, 2.067–3.808
- Ubi-int–(leer)–T35S · leere Expressionskassette, 3.838–5.572
- MCS · 4 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 2.036, 2.061
- SfiI ×2 · flankiert 2 Kassetten · Pos. 2.044, 5.601
- AscI/PacI · je eine Schnittstelle · Pos. 3.594, 5.590
- T-DNA-Grenzen (Borders) · LB, RB
Ligation of F517pBA-2xUbiZm2* into E753p7M2x35s-BSA*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| LB' | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P2x35s' | Promotor misc_feature | 174 | 958 | 785 | + |
| Bar' | Selektionsmarker CDS | 976 | 1.209 | 234 | + |
| STLS1 | Sonstiges misc_feature | 1.210 | 1.398 | 189 | + |
| ''Bar' | Selektionsmarker CDS | 1.399 | 1.716 | 318 | + |
| 'E9 | Terminator misc_feature | 1.736 | 2.026 | 291 | + |
| 'Ubi-int | Promotor misc_feature | 2.067 | 3.574 | 1.508 | + |
| Intron | Schnittstelle misc_feature | 3.053 | 3.572 | 520 | + |
| 'Thsp17 | Sonstiges misc_feature | 3.602 | 3.808 | 207 | + |
| 'Ubi-int | Promotor misc_feature | 3.838 | 5.345 | 1.508 | + |
| Intron | Schnittstelle misc_feature | 4.824 | 5.343 | 520 | + |
| T35S | Terminator misc_feature | 5.371 | 5.572 | 202 | + |
| Right Border Region | Sonstiges misc_feature | 5.632 | 6.234 | 603 | + |
| RB | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 5.677 | 5.700 | 24 | + |
| 'ColE1'' | Origin / Backbone misc_feature | 6.248 | 6.906 | 659 | + |
| ''pVS1 ORI''' | Origin / Backbone misc_feature | 6.935 | 8.898 | 1.964 | + |
| ParB | Kodierende Sequenz CDS | 7.261 | 8.436 | 1.176 | + |
| strep/spec | Selektionsmarker CDS | 9.087 | 10.097 | 1.011 | + |
| Left Border Region | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 10.165 | 163 | 0 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
p7M2x35s-UbiZ-UbiZ (H202; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p7M2x35s-UbiZ-UbiZ)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.