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DNA Cloning Service
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Binäre Vektoren

p9o-LH-U10-RNAi D489

Binärer Vektor mit 35s–nptII und Ubq10–int fad2, für Dikotyle.

24681012pVS1Pro-Ubq10Atint fad2Sm/SpColE1NptIIoP35SíntronNptIIoTE9bomOCSintUbi cds 5LBRBXhoI (727)SbfI, NcoIBamHI, BsrGIHpaI (4401)HindIII (4741)StuI, AflII, KpnI, PmeIAatII (5413)BsiWI, NheI, ClaID489p9o-LH-U10-R12.261 bp

GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq

Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.

Restriktionsschnittstellen

Single Cutter · SchnittstelleSchneidet beiLage
XhoI (PaeR7I)C^TCGAG727zwischen P35S und NptIIo
SbfI (SdaI)CCTGCA^GG2.048zwischen TE9 und Pro-Ubq10At
NcoIC^CATGG2.074zwischen TE9 und Pro-Ubq10At
BamHIG^GATCC3.569zwischen Pro-Ubq10At und splicing-site1
BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA3.580zwischen Pro-Ubq10At und splicing-site1
HpaI (KspAI)GTT^AAC4.401in int fad2
HindIIIA^AGCTT4.741zwischen splicing-site2 und OCS
StuI (Eco147I)AGG^CCT4.961zwischen OCS und RB
AflII (BspTI)C^TTAAG4.963zwischen OCS und RB
KpnI (Acc65I)GGTAC^C4.990zwischen OCS und RB
PmeI (MssI)GTTT^AAAC5.022zwischen OCS und RB
AatII (ZraI)GACGT^C5.413zwischen RB und ColE1
BsiWI (Pfl23II)C^GTACG9.627in pVS1
NheI (BmtI)G^CTAGC9.743in pVS1
ClaI (BspDI)AT^CGAT9.823in pVS1

Schneiden zweimal: EcoRI (2.747, 4.721), PstI (2.048, 4.717), SacI (1.255, 3.180), NdeI (6.528, 8.287), SpeI (3.563, 4.452), ApaI (828, 4.984), MluI (1.738, 4.747), SfiI (2.079, 4.967), MfeI (14, 1.148), AgeI (10.237, 10.545), BstEII (1.497, 11.108).

Keine Schnittstelle: SmaI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, NsiI, SacII, PvuII.

Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.

Promotor 1
35s
Gen 1
nptII
Promotor 2
Ubq10
Gen 2
int fad2
Merkmale
Dikotyle
Weitere Marker
NptIIo, Sm/Sp
Größe
12.261 bp, zirkulär
Datum des Eintrags
26-AUG-2020

Konstrukt

  • P35S–NptIIo · TE9 · Selektionskassette, 309–2.038
  • Pro-Ubq10At–int fad2 · OCS · Kassette mit Insert, 2.087–4.953
  • MCS · 4 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 4.961, 5.022
  • SfiI ×2 · flankiert die Kassette Pro-Ubq10At–int fad2 · Pos. 2.079, 4.967
  • T-DNA-Grenzen (Borders) · LB, RB

Ligation of iF2-Bam-Hind* into C599p9o-LH-U10-ocs*

Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.

300 €

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Annotierte Elemente

ElementTypStartEndeLängeStrang
LBT-DNA-Grenze (Border) misc_feature12424+
P35SPromotor misc_feature309724416+
NptIIoSelektionsmarker CDS7451.043299+
spliceSchnittstelle misc_feature1.0401.0434+
intSchnittstelle CDS1.0441.230187+
spliceSchnittstelle misc_feature1.2291.2324+
NptIIoSelektionsmarker CDS1.2311.734504+
TE9Terminator misc_feature1.7482.038291+
Pro-Ubq10AtPromotor misc_feature2.0873.5621.476+
TATASchnittstelle misc_feature3.1583.1614+
Ubi cds 5Promotor misc_feature3.1913.25464+
íntronSonstiges misc_feature3.2573.560304+
splicing-site1Schnittstelle misc_feature3.5843.5929+
int fad2Kodierende Sequenz CDS3.5874.7181.132+
splicing-site2Schnittstelle misc_feature4.7164.7205+
OCSTerminator misc_feature4.7584.953196+
RBT-DNA-Grenze (Border) misc_feature5.0385.06124+
ColE1Origin / Backbone misc_feature5.5966.293698+
bomOrigin / Backbone misc_feature6.3306.589260+
pVS1Origin / Backbone misc_feature6.84210.5473.706+
Sm/SpSelektionsmarker CDS10.73111.7411.011+

PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle

Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.

Zitierweise

Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.

p9o-LH-U10-RNAi (D489; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9o-LH-U10-RNAi)

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