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DNA Cloning Service
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Binäre Vektoren

p9oM-LH B475

Binärer Vektor mit 35s–nptII, für Monokotyle.

123456789pVS1Sm/SpColE1nptIIoP35SnptIIoTE9intLBRBXbaI (303)XmnI, XhoISacI (1255)PstI, SbfI, NcoI, SpeIBamHI, SmaI, NsiI, EcoRIHindIII, SalI, StuI, AflIIBglII, KpnI, PmeIAatII (2596)BsiWI, NheIB475p9oM-LH9.444 bp

GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq

Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.

Restriktionsschnittstellen

Single Cutter · SchnittstelleSchneidet beiLage
XbaIT^CTAGA303zwischen LB und P35S
XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC594in P35S
XhoI (PaeR7I)C^TCGAG727zwischen P35S und nptIIo
SacI (Ecl136II)GAGCT^C1.255in nptIIo
PstICTGCA^G2.055zwischen TE9 und RB
SbfI (SdaI)CCTGCA^GG2.055zwischen TE9 und RB
NcoIC^CATGG2.081zwischen TE9 und RB
SpeIA^CTAGT2.094zwischen TE9 und RB
BamHIG^GATCC2.100zwischen TE9 und RB
SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG2.108zwischen TE9 und RB
NsiI (Mph1103I)ATGCA^T2.116zwischen TE9 und RB
EcoRIG^AATTC2.118zwischen TE9 und RB
HindIIIA^AGCTT2.124zwischen TE9 und RB
SalIG^TCGAC2.136zwischen TE9 und RB
StuI (Eco147I)AGG^CCT2.144zwischen TE9 und RB
AflII (BspTI)C^TTAAG2.146zwischen TE9 und RB
BglIIA^GATCT2.156zwischen TE9 und RB
KpnI (Acc65I)GGTAC^C2.173zwischen TE9 und RB
PmeI (MssI)GTTT^AAAC2.205zwischen TE9 und RB
AatII (ZraI)GACGT^C2.596zwischen RB und ColE1
BsiWI (Pfl23II)C^GTACG6.810in pVS1
NheI (BmtI)G^CTAGC6.926in pVS1

Schneiden zweimal: SphI (2.061, 2.330), NdeI (3.711, 5.470), ClaI (2.131, 7.006), EcoRV (634, 2.717), ApaI (828, 2.167), SfiI (2.086, 2.150), MfeI (14, 1.148), AgeI (7.420, 7.728), BstEII (1.497, 8.291), BsmBI (3.889, 4.942), SapI (3.649, 7.546), AarI (1.218, 1.339).

Keine Schnittstelle: MluI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, BsrGI, SacII, PvuII.

Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.

Promotor 1
35s
Gen 1
nptII
Merkmale
Monokotyle
Weitere Marker
nptIIo, Sm/Sp
Größe
9.444 bp, zirkulär
Datum des Eintrags
22-JAN-2016

Konstrukt

  • P35S–nptIIo · TE9 · Selektionskassette, 309–2.045
  • MCS · 15 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 2.055, 2.205
  • SfiI ×2 · flankiert die MCS · Pos. 2.086, 2.150
  • T-DNA-Grenzen (Borders) · LB, RB

B475p9oM-LH rotated to position 9197

Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.

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Annotierte Elemente

ElementTypStartEndeLängeStrang
LBT-DNA-Grenze (Border) misc_feature12424+
P35SPromotor misc_feature309724416+
nptIIoSelektionsmarker CDS7451.043299+
intSchnittstelle CDS1.0441.230187+
nptIIoSelektionsmarker CDS1.2311.737507+
TE9Terminator misc_feature1.7552.045291+
RBT-DNA-Grenze (Border) misc_feature2.2212.24424+
ColE1Origin / Backbone misc_feature2.7793.476698+
pVS1Origin / Backbone misc_feature4.0257.7303.706+
Sm/SpSelektionsmarker CDS7.9148.9241.011+

PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle

Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.

Zitierweise

Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.

p9oM-LH (B475; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9oM-LH)

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