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DNA Cloning Service
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CRISPR/Cas

p7ioR-35sCasWToi C034

CRISPR/Cas-Vektor mit 35s–bar und 35s–Cas9.

24681012'Cas9WT'pVS1Sm/SpColE1'RNA'U6At35S-Pro35S''Bar''E9NOS-TBar'STLS1gRNANLSLBRBXbaI (303)XhoI (727)AarI (1268)MluI (1486)PstI, SbfISpeI, BamHI, SacISmaI, NsiI, EcoRIBstBI, HindIII, SalI, KpnIPmeI (7373)FseI (10571)BsiWI, NheI, ClaIBstEII (12280)C034p7ioR-35sCas13.433 bp

GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq

Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.

Restriktionsschnittstellen

Single Cutter · SchnittstelleSchneidet beiLage
XbaIT^CTAGA303zwischen LB und 35S
XhoI (PaeR7I)C^TCGAG727zwischen 35S und Bar'
AarICACCTGC(4/8)1.268in 'Bar'
MluIA^CGCGT1.486zwischen 'Bar' und E9
PstICTGCA^G1.796zwischen E9 und 35S-Pro
SbfI (SdaI)CCTGCA^GG1.796zwischen E9 und 35S-Pro
SpeIA^CTAGT2.262zwischen 35S-Pro und Cas9WT
BamHIG^GATCC2.269zwischen 35S-Pro und Cas9WT
SacI (Ecl136II)GAGCT^C2.325in Cas9WT
SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG6.483zwischen Cas9WT und NOS-T
NsiI (Mph1103I)ATGCA^T6.606in NOS-T
EcoRIG^AATTC6.743zwischen NOS-T und RNA'
BstBI (Bsp119I)TT^CGAA7.201in targetRNA
HindIIIA^AGCTT7.204in targetRNA
SalIG^TCGAC7.304zwischen RNA' und RB
KpnI (Acc65I)GGTAC^C7.341zwischen RNA' und RB
PmeI (MssI)GTTT^AAAC7.373zwischen RNA' und RB
FseIGGCCGG^CC10.571in pVS1
BsiWI (Pfl23II)C^GTACG10.799in pVS1
NheI (BmtI)G^CTAGC10.915in pVS1
ClaI (BspDI)AT^CGAT10.995in pVS1
BstEII (Eco91I)G^GTNACC12.280in Sm/Sp

Schneiden zweimal: NcoI (1.822, 3.748), NdeI (8.879, 9.459), BglII (2.576, 7.324), SfiI (1.827, 7.318), MfeI (14, 1.085), AgeI (11.409, 11.717), StuI (5.045, 7.312), AatII (2.867, 7.764), BsmBI (7.188, 7.220).

Keine Schnittstelle: AscI, PacI, SwaI, AvrII, HpaI, BsrGI.

Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.

Promotor 1
35s
Gen 1
bar
Promotor 2
35s
Gen 2
Cas9
Merkmale
U6At
Weitere Marker
Bar', 'Bar', Sm/Sp
Größe
13.433 bp, zirkulär
Datum des Eintrags
14-JUL-2016

Konstrukt

  • 35S–Bar · E9 · Selektionskassette, 309–1.786
  • 35S-Pro–Cas9WT · NOS-T · Kassette mit Insert, 1.841–6.739
  • SfiI ×2 · flankiert die Kassette 35S-Pro–Cas9WT · Pos. 1.827, 7.318
  • BsmBI Golden Gate · Überhänge TGAT, GTTT · Pos. 7.188, 7.220
  • T-DNA-Grenzen (Borders) · LB, RB

Ligation of B414p7o-LH* into B792p6ioR-35sCasWToi*

Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.

400 €

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Annotierte Elemente

ElementTypStartEndeLängeStrang
LBT-DNA-Grenze (Border) misc_feature12424+
35SPromotor misc_feature309724416+
Bar'Selektionsmarker CDS745978234+
STLS1Sonstiges misc_feature9791.167189+
''Bar'Selektionsmarker CDS1.1681.483316+
'E9Terminator misc_feature1.4961.786291+
35S-ProPromotor misc_feature1.8412.258418+
TATA-boxSchnittstelle CDS2.2292.2357+
'Cas9WTKodierende Sequenz CDS2.2846.4804.197+
NLSSchnittstelle misc_feature2.2902.31021+
NLSSchnittstelle misc_feature6.4306.47748+
NOS-TTerminator misc_feature6.4866.739254+
'RNA'Sonstiges misc_feature6.7447.304561+
U6AtKodierende Sequenz CDS6.7497.193445+
targetRNASchnittstelle CDS7.1947.22027+
hairpinSchnittstelle CDS7.2217.25030+
gRNASchnittstelle misc_feature7.2217.30383+
RBT-DNA-Grenze (Border) misc_feature7.3897.41224+
ColE1Origin / Backbone misc_feature7.9478.644698+
'pVS1Origin / Backbone misc_feature8.93211.7192.788+
Sm/SpSelektionsmarker CDS11.90312.9131.011+

PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle

Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.

Zitierweise

Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.

p7ioR-35sCasWToi (C034; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/crispr/p7ioR-35sCasWToi)

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