p1U
pUC-Klonierungsvektor.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| PacITTAAT^TAA | 58 | zwischen ColE1 und Ubi-maize |
| NotIGC^GGCCGC | 64 | zwischen ColE1 und Ubi-maize |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 64 | zwischen ColE1 und Ubi-maize |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 310 | in Ubi-maize |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 776 | in Ubi-maize |
| BglIIA^GATCT | 1.023 | in Ubi-maize |
| NcoIC^CATGG | 1.123 | in Intron |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 1.136 | in Intron |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 1.196 | in Intron |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 1.309 | in Intron |
| SpeIA^CTAGT | 1.586 | zwischen Ubi-maize und Tnos |
| BamHIG^GATCC | 1.593 | zwischen Ubi-maize und Tnos |
| FseIGGCCGG^CC | 1.605 | zwischen Ubi-maize und Tnos |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1.612 | zwischen Ubi-maize und Tnos |
| EcoRIG^AATTC | 1.615 | zwischen Ubi-maize und Tnos |
| HindIIIA^AGCTT | 1.622 | zwischen Ubi-maize und Tnos |
| AscI (SgsI)GG^CGCGCC | 1.629 | zwischen Ubi-maize und Tnos |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 1.640 | zwischen Ubi-maize und Tnos |
| SalIG^TCGAC | 1.643 | zwischen Ubi-maize und Tnos |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 1.678 | in Tnos |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 1.906 | zwischen Tnos und Amp |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 1.911 | zwischen Tnos und Amp |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 1.927 | zwischen Tnos und Amp |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 2.171 | in Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 2.705 | in Amp |
Schneiden zweimal: XbaI (109, 1.104), SfiI (48, 1.924), NsiI (1.354, 1.769).
Keine Schnittstelle: SphI, SmaI, EcoRV, MluI, PmeI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, HpaI, BsrGI, SacII, PvuII, AatII, BstEII, BbsI, BsmBI, SapI, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 2
- UbiZm
- Gen 2
- MCS
- Merkmale
- Ubi-maize-Promotorkassette
- Weitere Marker
- Amp
- Größe
- 3.501 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 14-JUL-2010
Konstrukt
- Ubi-maize–(leer)–Tnos · leere Expressionskassette, 77–1.902
- MCS · 10 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 1.586, 1.678
- SfiI ×2 · flankiert die Kassette Ubi-maize–(empty)–Tnos · Pos. 48, 1.924
- AscI/PacI · je eine Schnittstelle · Pos. 58, 1.629
Ligation of pLNU* into pD1AF*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| Ubi-maize | Promotor misc_feature | 77 | 1.585 | 1.509 | + |
| Intron | Schnittstelle misc_feature | 1.064 | 1.583 | 520 | + |
| Tnos | Terminator misc_feature | 1.649 | 1.902 | 254 | + |
| Amp | Selektionsmarker CDS | 1.984 | 2.846 | 863 | + |
| ColE1 | Schnittstelle misc_feature | 2.847 | 10 | 0 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
p1U (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/p1U)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.
Verwendet in
- Phytoplasma SAP11 effector destabilization of TCP transcription factors differentially impact development and defence of Arabidopsis versus maize – Pecher P, Moro G, Canale MC, et al., PLOS Pathogens 2019; 15:e1008035