p2x35s-mGFPM-ocs B594
pUC-Klonierungsvektor mit 2x35s–GFP, für Monokotyle.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 77 | zwischen ColE1 und P2x35s |
| XbaIT^CTAGA | 79 | zwischen ColE1 und P2x35s |
| NcoIC^CATGG | 87 | zwischen ColE1 und P2x35s |
| NotIGC^GGCCGC | 93 | zwischen ColE1 und P2x35s |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 93 | zwischen ColE1 und P2x35s |
| SpeIA^CTAGT | 100 | zwischen ColE1 und P2x35s |
| BamHIG^GATCC | 106 | zwischen ColE1 und P2x35s |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 114 | zwischen ColE1 und P2x35s |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 781 | in P2x35s |
| HindIIIA^AGCTT | 919 | zwischen P2x35s und gfp |
| MluIA^CGCGT | 925 | zwischen P2x35s und gfp |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 1.282 | in gfp |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 1.427 | in int |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 1.513 | in gfp |
| SalIG^TCGAC | 1.851 | zwischen gfp und Tocs |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 1.871 | in Tocs |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2.059 | zwischen Tocs und Amp |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2.061 | zwischen Tocs und Amp |
| BglIIA^GATCT | 2.071 | zwischen Tocs und Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 2.082 | zwischen Tocs und Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 3.588 | in Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 4.659 | zwischen ColE1 und P2x35s |
Schneiden zweimal: KpnI (1.163, 2.088), SfiI (92, 2.065), PvuI (2.240, 3.285), PvuII (2.209, 4.722).
Keine Schnittstelle: EcoRI, PstI, SphI, XhoI, NdeI, NheI, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, HpaI, NsiI, BsrGI, SacII, AatII, BstEII, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 2
- 2x35s
- Gen 2
- GFP
- Merkmale
- Monokotyle
- Weitere Marker
- Amp
- Größe
- 4.867 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 22-JAN-2016
Konstrukt
- P2x35s–gfp · Tocs · Kassette mit Insert, 129–2.051
- MCS · 8 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 77, 114
- SfiI ×2 · flankiert die Kassette P2x35s–gfp · Pos. 92, 2.065
Ligation of B442pmGFPM-ocs* into B496p2x35s-MoGusi-ocs*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| P2x35s | Promotor misc_feature | 129 | 913 | 785 | + |
| mut | Schnittstelle misc_signal | 743 | 743 | 1 | + |
| TATA | Schnittstelle misc_signal | 841 | 847 | 7 | + |
| gfp | Kodierende Sequenz CDS | 942 | 1.320 | 379 | + |
| int | Schnittstelle CDS | 1.321 | 1.509 | 189 | + |
| gfp | Kodierende Sequenz CDS | 1.510 | 1.847 | 338 | + |
| Tocs | Terminator misc_feature | 1.856 | 2.051 | 196 | + |
| Amp | Selektionsmarker misc_feature | 2.867 | 3.727 | 861 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone CDS | 3.770 | 4.486 | 717 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
p2x35s-mGFPM-ocs (B594; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/p2x35s-mGFPM-ocs)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.