pD35s-LmEGFP D467
pUC-Klonierungsvektor mit 35s–mEGFP, für Monokotyle und Dikotyle.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 77 | zwischen ColE1 und P35S |
| XbaIT^CTAGA | 79 | zwischen ColE1 und P35S |
| NcoIC^CATGG | 87 | zwischen ColE1 und P35S |
| NotIGC^GGCCGC | 93 | zwischen ColE1 und P35S |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 93 | zwischen ColE1 und P35S |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 762 | in P35S |
| SpeIA^CTAGT | 898 | zwischen P35S und mEGFP |
| BamHIG^GATCC | 905 | zwischen P35S und mEGFP |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 913 | zwischen P35S und mEGFP |
| PstICTGCA^G | 921 | zwischen P35S und mEGFP |
| EcoRIG^AATTC | 923 | zwischen P35S und mEGFP |
| HindIIIA^AGCTT | 929 | zwischen P35S und mEGFP |
| MluIA^CGCGT | 935 | zwischen P35S und mEGFP |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 941 | zwischen P35S und mEGFP |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 1.338 | in mEGFP |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 1.483 | in ST-LS1 |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 1.569 | in mEGFP |
| SalIG^TCGAC | 1.908 | zwischen mEGFP und OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 1.928 | in OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2.116 | zwischen OCS und Amp |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2.118 | zwischen OCS und Amp |
| BglIIA^GATCT | 2.128 | zwischen OCS und Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 2.139 | zwischen OCS und Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2.145 | zwischen OCS und Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 3.645 | in Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 4.716 | zwischen ColE1 und P35S |
Schneiden zweimal: SfiI (92, 2.122), PvuI (2.297, 3.342), PvuII (2.266, 4.779).
Keine Schnittstelle: SphI, XhoI, NdeI, NheI, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, HpaI, NsiI, SacII, AatII, BstEII, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 1
- 35s
- Gen 1
- mEGFP
- Merkmale
- Dikotyle und Monokotyle
- Weitere Marker
- Amp
- Größe
- 4.924 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 26-AUG-2020
Konstrukt
- P35S–mEGFP · OCS · Kassette mit Insert, 110–2.108
- MCS · 8 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 898, 941
- SfiI ×2 · flankiert die Kassette P35S–mEGFP · Pos. 92, 2.122
Ligation of P2x35S* into D360p35s-LmEGFP*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| P35S | Promotor misc_feature | 110 | 894 | 785 | + |
| eh1 | Sonstiges misc_feature | 111 | 436 | 326 | + |
| enh2 | Sonstiges misc_feature | 436 | 761 | 326 | + |
| mut | Schnittstelle misc_feature | 724 | 724 | 1 | + |
| TATA | Schnittstelle misc_feature | 822 | 828 | 7 | + |
| mEGFP | Kodierende Sequenz CDS | 998 | 1.376 | 379 | + |
| F64L/S65T - enhanced fluorescence | Schnittstelle misc_feature | 1.187 | 1.192 | 6 | + |
| ST-LS1 | Kodierende Sequenz CDS | 1.377 | 1.565 | 189 | + |
| mEGFP | Kodierende Sequenz CDS | 1.566 | 1.903 | 338 | + |
| A206K - monomeric protein | Schnittstelle misc_feature | 1.802 | 1.804 | 3 | + |
| OCS | Terminator misc_feature | 1.913 | 2.108 | 196 | + |
| Amp | Selektionsmarker misc_feature | 2.924 | 3.784 | 861 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone misc_feature | 3.827 | 4.543 | 717 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
pD35s-LmEGFP (D467; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pD35s-LmEGFP)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.