pLN35
pUC-Klonierungsvektor.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| PacITTAAT^TAA | 43 | zwischen Amp und LoxP |
| NotIGC^GGCCGC | 82 | zwischen LoxP und P35s |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 82 | zwischen LoxP und P35s |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 424 | in P35s |
| SpeIA^CTAGT | 517 | zwischen P35s und Tnos |
| BamHIG^GATCC | 524 | zwischen P35s und Tnos |
| FseIGGCCGG^CC | 536 | zwischen P35s und Tnos |
| PstICTGCA^G | 543 | zwischen P35s und Tnos |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 543 | zwischen P35s und Tnos |
| EcoRIG^AATTC | 546 | zwischen P35s und Tnos |
| HindIIIA^AGCTT | 553 | zwischen P35s und Tnos |
| AscI (SgsI)GG^CGCGCC | 560 | zwischen P35s und Tnos |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 571 | zwischen P35s und Tnos |
| SalIG^TCGAC | 574 | zwischen P35s und Tnos |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 609 | in Tnos |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 700 | in Tnos |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 837 | zwischen Tnos und LoxP |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 875 | zwischen LoxP und ColE1 |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 891 | zwischen LoxP und ColE1 |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 1.773 | in Amp |
Schneiden zweimal: SfiI (33, 888), PvuI (582, 2.082), XmnI (384, 2.311).
Keine Schnittstelle: XbaI, SphI, SmaI, XhoI, NcoI, NdeI, NheI, BglII, ClaI, ApaI, MluI, PmeI, AvrII, BsiWI, MfeI, AgeI, BstBI, HpaI, BsrGI, SacII, PvuII, AatII, BstEII, BsmBI, SapI, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 2
- 35s
- Gen 2
- MCS
- Merkmale
- Lox-Sites in der Promotorkassette
- Weitere Marker
- Amp
- Größe
- 2.655 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 14-JUL-2010
Konstrukt
- P35s–(leer)–Tnos · leere Expressionskassette, 95–833
- MCS · 11 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 517, 609
- SfiI ×2 · flankiert die Kassette P35s–(empty)–Tnos · Pos. 33, 888
- AscI/PacI · je eine Schnittstelle · Pos. 43, 560
Lox-Nos-35S rotated to position 2623
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| LoxP | Schnittstelle misc_feature | 46 | 79 | 34 | + |
| P35s | Promotor misc_feature | 95 | 513 | 419 | + |
| Tnos | Terminator misc_feature | 580 | 833 | 254 | + |
| LoxP | Schnittstelle misc_feature | 840 | 873 | 34 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone misc_feature | 923 | 1.589 | 667 | − |
| Amp | Selektionsmarker CDS | 1.639 | 2.499 | 861 | − |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
pLN35 (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pLN35; RRID:SCR_029231)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.