pUbiAt-mGFPD-ocs B592
pUC-Klonierungsvektor mit Ubq10–GFP, für Dikotyle.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| NcoIC^CATGG | 15 | zwischen ColE1 und UBQ10 |
| NotIGC^GGCCGC | 21 | zwischen ColE1 und UBQ10 |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 21 | zwischen ColE1 und UBQ10 |
| SpeIA^CTAGT | 28 | zwischen ColE1 und UBQ10 |
| BamHIG^GATCC | 34 | zwischen ColE1 und UBQ10 |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 42 | zwischen ColE1 und UBQ10 |
| EcoRIG^AATTC | 706 | in UBQ10 |
| BbsI (BpiI)GAAGAC(2/6) | 1.326 | in int |
| HindIIIA^AGCTT | 1.524 | zwischen UBQ10 und gfp |
| MluIA^CGCGT | 1.530 | zwischen UBQ10 und gfp |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 1.887 | in gfp |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 2.032 | in int |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 2.118 | in gfp |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 2.476 | in Tocs |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2.664 | zwischen Tocs und Amp |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2.666 | zwischen Tocs und Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 2.687 | zwischen Tocs und Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 4.193 | in Amp |
Schneiden zweimal: SalI (884, 2.456), KpnI (1.768, 2.693), SacI (5, 1.139), BglII (1.451, 2.676), EcoRV (1.349, 1.382), SfiI (20, 2.670), PvuII (2.814, 5.327), XmnI (307, 3.659), SapI (1.144, 5.264).
Keine Schnittstelle: PstI, SphI, XhoI, NdeI, NheI, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, HpaI, NsiI, BsrGI, SacII, AatII, BstEII, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 2
- Ubq10
- Gen 2
- GFP
- Merkmale
- Dikotyle
- Weitere Marker
- Amp
- Größe
- 5.544 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 22-JAN-2016
Konstrukt
- UBQ10–gfp · Tocs · Kassette mit Insert, 46–2.656
- MCS · 6 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 15, 42
- SfiI ×2 · flankiert die Kassette UBQ10–gfp · Pos. 20, 2.670
Ligation of B494pUbiAt-DoGusi-ocs* into B444pmGFPD-ocs*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| UBQ10 | Sonstiges misc_feature | 46 | 1.521 | 1.476 | + |
| Ubi cds 5 | Promotor misc_feature | 1.150 | 1.213 | 64 | + |
| int | Schnittstelle misc_feature | 1.216 | 1.519 | 304 | + |
| gfp | Kodierende Sequenz CDS | 1.547 | 1.925 | 379 | + |
| int | Schnittstelle CDS | 1.926 | 2.114 | 189 | + |
| gfp | Kodierende Sequenz CDS | 2.115 | 2.452 | 338 | + |
| Tocs | Terminator misc_feature | 2.461 | 2.656 | 196 | + |
| Amp | Selektionsmarker misc_feature | 3.472 | 4.332 | 861 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone CDS | 4.375 | 5.091 | 717 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
pUbiAt-mGFPD-ocs (B592; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pUbiAt-mGFPD-ocs; RRID:SCR_029231)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.