pUbiZm-LGFP B633
pUC-Klonierungsvektor mit UbiZm–Link-GFP, für Monokotyle.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 77 | zwischen ColE1 und UbiZm |
| NotIGC^GGCCGC | 93 | zwischen ColE1 und UbiZm |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 93 | zwischen ColE1 und UbiZm |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 805 | in UbiZm |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 1.225 | in int |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 1.383 | in int |
| SpeIA^CTAGT | 1.615 | zwischen UbiZm und link |
| BamHIG^GATCC | 1.622 | zwischen UbiZm und link |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1.630 | zwischen UbiZm und link |
| EcoRIG^AATTC | 1.640 | zwischen UbiZm und link |
| HindIIIA^AGCTT | 1.646 | zwischen UbiZm und link |
| MluIA^CGCGT | 1.652 | zwischen UbiZm und link |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 1.658 | zwischen UbiZm und link |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 2.055 | in gfpm |
| SalIG^TCGAC | 2.625 | zwischen gfpm und Tocs |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 2.645 | in Tocs |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2.833 | zwischen Tocs und Amp |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2.835 | zwischen Tocs und Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2.862 | zwischen Tocs und Amp |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 3.828 | in Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 4.362 | in Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 5.433 | zwischen ColE1 und UbiZm |
Schneiden zweimal: NcoI (87, 1.152), BglII (1.052, 2.845), ClaI (1.338, 2.286), ApaI (1.165, 2.856), SfiI (92, 2.839), MfeI (339, 2.200), PvuII (2.983, 5.496).
Keine Schnittstelle: SphI, EcoRV, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, HpaI, SacII, AatII, BstEII, BbsI, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 2
- UbiZm
- Gen 2
- Link-GFP
- Merkmale
- Monokotyle
- Weitere Marker
- Amp
- Größe
- 5.641 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 08-FEB-2016
Konstrukt
- UbiZm–gfpm · Tocs · Kassette mit Insert, 106–2.825
- MCS · 7 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 1.615, 1.658
- SfiI ×2 · flankiert die Kassette UbiZm–gfpm · Pos. 92, 2.839
Ligation of pLNU* into B636pLGFP-ocs*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| UbiZm | Promotor misc_feature | 106 | 1.614 | 1.509 | + |
| int | Schnittstelle misc_feature | 1.093 | 1.612 | 520 | + |
| link | Sonstiges misc_feature | 1.664 | 1.714 | 51 | + |
| gfpm | Kodierende Sequenz CDS | 1.715 | 2.093 | 379 | + |
| int | Schnittstelle CDS | 2.094 | 2.282 | 189 | + |
| gfpm | Kodierende Sequenz CDS | 2.283 | 2.620 | 338 | + |
| Tocs | Terminator misc_feature | 2.630 | 2.825 | 196 | + |
| Amp | Selektionsmarker misc_feature | 3.641 | 4.501 | 861 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone CDS | 4.544 | 5.260 | 717 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
pUbiZm-LGFP (B633; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pUbiZm-LGFP; RRID:SCR_029231)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.