pmGFPM-nos B443
pUC-Klonierungsvektor mit MCS–GFP, für Monokotyle.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 103 | zwischen ColE1 und gfp |
| XbaIT^CTAGA | 105 | zwischen ColE1 und gfp |
| NcoIC^CATGG | 113 | zwischen ColE1 und gfp |
| NotIGC^GGCCGC | 119 | zwischen ColE1 und gfp |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 119 | zwischen ColE1 und gfp |
| SpeIA^CTAGT | 126 | zwischen ColE1 und gfp |
| BamHIG^GATCC | 132 | zwischen ColE1 und gfp |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 140 | zwischen ColE1 und gfp |
| PstICTGCA^G | 148 | zwischen ColE1 und gfp |
| EcoRIG^AATTC | 150 | zwischen ColE1 und gfp |
| HindIIIA^AGCTT | 156 | zwischen ColE1 und gfp |
| MluIA^CGCGT | 162 | zwischen ColE1 und gfp |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 519 | in gfp |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 664 | in int |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 750 | in gfp |
| SalIG^TCGAC | 1.088 | zwischen gfp und Tnos |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 1.226 | in Tnos |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 1.368 | zwischen Tnos und Amp |
| BglIIA^GATCT | 1.380 | zwischen Tnos und Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 1.391 | zwischen Tnos und Amp |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 2.363 | in Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 2.897 | in Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 3.968 | zwischen ColE1 und gfp |
Schneiden zweimal: KpnI (400, 1.397), SfiI (118, 1.374), AflII (1.135, 1.370), PvuII (1.518, 4.031).
Keine Schnittstelle: SphI, XhoI, NdeI, NheI, EcoRV, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, HpaI, BsrGI, SacII, AatII, BstEII, BbsI, BsmBI, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 2
- MCS
- Gen 2
- GFP
- Merkmale
- Monokotyle
- Weitere Marker
- Amp
- Größe
- 4.150 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 22-JAN-2016
Konstrukt
- MCS · 12 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 103, 162
- SfiI ×2 · flankiert die MCS · Pos. 118, 1.374
Ligation of GFPmon-Hind-Sal* into pNos-BM*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| gfp | Kodierende Sequenz CDS | 179 | 557 | 379 | + |
| int | Schnittstelle CDS | 558 | 746 | 189 | + |
| gfp | Kodierende Sequenz CDS | 747 | 1.084 | 338 | + |
| Tnos | Terminator misc_feature | 1.106 | 1.359 | 254 | + |
| Amp | Selektionsmarker misc_feature | 2.176 | 3.036 | 861 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone CDS | 3.079 | 3.795 | 717 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
pmGFPM-nos (B443; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pmGFPM-nos)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.