pLN35-Gus-RNAi
RNAi-Vektor mit 35S–Gus-Spacer-Gus.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| PacITTAAT^TAA | 43 | zwischen Amp und loxP |
| NotIGC^GGCCGC | 82 | zwischen loxP und P35s |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 82 | zwischen loxP und P35s |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 424 | in P35s |
| SpeIA^CTAGT | 517 | zwischen P35s und GUS-sense |
| BamHIG^GATCC | 1.070 | zwischen GUS-sense und Spacer-GUS |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 1.355 | in Spacer-GUS |
| AarICACCTGC(4/8) | 1.594 | in Spacer-GUS |
| EcoRIG^AATTC | 2.117 | zwischen Spacer-GUS und GUS-AS |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 2.677 | zwischen GUS-AS und Tnos |
| SalIG^TCGAC | 2.680 | zwischen GUS-AS und Tnos |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2.715 | in Tnos |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 2.806 | in Tnos |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2.943 | zwischen Tnos und LoxP |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 2.981 | zwischen LoxP und ColE1 |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2.997 | zwischen LoxP und ColE1 |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 3.879 | in Amp |
Schneiden zweimal: MluI (1.555, 1.573), SfiI (33, 2.994), MfeI (649, 2.539), BsrGI (1.382, 1.808), PvuI (2.688, 4.188), XmnI (384, 4.417).
Keine Schnittstelle: HindIII, XbaI, PstI, SphI, SmaI, XhoI, NcoI, NdeI, NheI, BglII, ClaI, ApaI, AscI, SbfI, FseI, PmeI, AvrII, BsiWI, AgeI, HpaI, SacII, PvuII, AatII, BstEII, BsmBI, SapI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 2
- 35S
- Gen 2
- Gus-Spacer-Gus
- Merkmale
- Hairpin-Konstrukt mit Spacer, Lox-Sites in der Kassette
- Weitere Marker
- Amp
- Größe
- 4.761 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 13-JUL-2010
Konstrukt
- P35s–GUS-sense · Spacer-GUS · Kassette mit Insert, 95–2.073
- SfiI ×2 · flankiert die Kassette P35s–GUS-sense · Pos. 33, 2.994
Ligation of GusAS into pLN35-GusS-SG
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| loxP | Schnittstelle misc_feature | 46 | 79 | 34 | + |
| P35s | Promotor misc_feature | 95 | 513 | 419 | + |
| GUS-sense | Kodierende Sequenz CDS | 521 | 1.070 | 550 | + |
| Spacer-GUS | Terminator misc_feature | 1.072 | 2.073 | 1.002 | + |
| GUS-AS | Kodierende Sequenz CDS | 2.121 | 2.672 | 552 | − |
| Tnos | Terminator misc_feature | 2.686 | 2.939 | 254 | + |
| LoxP | Schnittstelle misc_feature | 2.946 | 2.979 | 34 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone misc_feature | 3.029 | 3.695 | 667 | − |
| Amp | Selektionsmarker CDS | 3.745 | 4.605 | 861 | − |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
pLN35-Gus-RNAi (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/rnai/pLN35-Gus-RNAi)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.