p6D35s D010
Vector binario con 35s–hptII, para dicotiledóneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 163 | entre Left Border Region y P35S |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 587 | entre P35S y Kozak |
| MluIA^CGCGT | 1820 | entre hptII y TE9 |
| PstICTGCA^G | 2130 | entre TE9 y Right Border Region |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2130 | entre TE9 y Right Border Region |
| NotIGC^GGCCGC | 2139 | entre TE9 y Right Border Region |
| SpeIA^CTAGT | 2149 | entre TE9 y Right Border Region |
| BamHIG^GATCC | 2158 | entre TE9 y Right Border Region |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 2169 | entre TE9 y Right Border Region |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 2176 | entre TE9 y Right Border Region |
| EcoRIG^AATTC | 2185 | entre TE9 y Right Border Region |
| HindIIIA^AGCTT | 2194 | entre TE9 y Right Border Region |
| SalIG^TCGAC | 2203 | entre TE9 y Right Border Region |
| BglIIA^GATCT | 2223 | entre TE9 y Right Border Region |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 2236 | entre TE9 y Right Border Region |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2245 | entre TE9 y Right Border Region |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 2277 | en Right Border Region |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 2402 | en Right Border Region |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 2668 | en Right Border Region |
Corte doble: EcoRV (494, 2789), SfiI (2138, 2217), MfeI (14, 1281), EagI (2139, 2659), SacII (975, 1805), PvuI (2612, 6301).
Sin sitio: SacI, NcoI, NdeI, NheI, ClaI, AscI, PacI, FseI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, HpaI, NsiI, AflII, PvuII, BsaI, BsmBI, SapI, AarI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 1
- 35s
- Gen 1
- hptII
- Características
- dicotiledóneas
- Otros marcadores
- strep/spec
- Tamaño
- 6930 bp, circular
- Fecha del registro
- 25-AUG-2020
Construcción
- P35S–hptII · TE9 · casete de selección, 169–2120
- MCS · 14 sitios únicos · en 2130, 2277
- SfiI ×2 · flanquea el MCS · en 2138, 2217
- Bordes del T-DNA · LB, RB
Ligation of hpt-xho-bsa* into C907p6D35s*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| LB' | Borde del T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P35S | Promotor misc_feature | 169 | 584 | 416 | + |
| Kozak | Sitio misc_feature | 600 | 604 | 5 | + |
| hptII | Marcador de selección CDS | 605 | 1174 | 570 | + |
| int | Sitio misc_feature | 1175 | 1363 | 189 | + |
| hptII | Marcador de selección CDS | 1364 | 1819 | 456 | + |
| TE9 | Terminador misc_feature | 1830 | 2120 | 291 | + |
| Right Border Region | Otro misc_feature | 2248 | 2850 | 603 | + |
| RB | Borde del T-DNA misc_feature | 2293 | 2316 | 24 | + |
| ColE1 | Origen / backbone misc_feature | 2864 | 3522 | 659 | + |
| ''pVS1 ORI''' | Origen / backbone misc_feature | 3551 | 5514 | 1964 | + |
| ParB | Secuencia codificante CDS | 3877 | 5052 | 1176 | + |
| strep/spec | Marcador de selección CDS | 5703 | 6713 | 1011 | + |
| Left Border Region | Borde del T-DNA misc_feature | 6781 | 163 | 0 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
p6D35s (D010; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6D35s)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.
Utilizado en
- Transgenic Production of an Anti HIV Antibody in the Barley Endosperm – Hensel G, Floss DM, Arcalis E, et al., PLOS ONE 2015; 10:e0140476