p6oM-35s-ocs D389
Vector binario con 35s–hptII, para monocotiledóneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 303 | entre LB y P35S |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 727 | entre P35S y Kozak |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2277 | entre TE9 y 35S-Pro |
| NcoIC^CATGG | 2303 | entre TE9 y 35S-Pro |
| SpeIA^CTAGT | 2743 | en 35S-Pro |
| BamHIG^GATCC | 2750 | entre 35S-Pro y OCS |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 2758 | entre 35S-Pro y OCS |
| EcoRIG^AATTC | 2768 | entre 35S-Pro y OCS |
| HindIIIA^AGCTT | 2774 | entre 35S-Pro y OCS |
| MluIA^CGCGT | 2780 | entre 35S-Pro y OCS |
| SalIG^TCGAC | 2786 | entre 35S-Pro y OCS |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2996 | entre OCS y RB |
| BglIIA^GATCT | 3006 | entre OCS y RB |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 3017 | entre OCS y RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3023 | entre OCS y RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 3055 | entre OCS y RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 3446 | entre RB y ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 7660 | en pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 7776 | en pVS1 |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 7856 | en pVS1 |
Corte doble: PstI (2277, 2766), SphI (2283, 3180), NdeI (4561, 6320), SfiI (2308, 3000), FseI (5327, 7432), MfeI (14, 1421), AgeI (8270, 8578), StuI (1641, 2994), SacII (1115, 1945), BstEII (1035, 9141), SapI (4499, 8396).
Sin sitio: SacI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, NsiI, BsrGI, PvuII, AarI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 1
- 35s
- Gen 1
- hptII
- Promotor 2
- 35s
- Características
- monocotiledóneas
- Otros marcadores
- Sm/Sp
- Tamaño
- 10.294 bp, circular
- Fecha del registro
- 16-AUG-2020
Construcción
- P35S–hptII · TE9 · casete de selección, 309–2267
- 35S-Pro–(vacío)–OCS · casete de expresión vacío, 2322–2986
- MCS · 7 sitios únicos · en 2743, 2786
- SfiI ×2 · flanquea el casete 35S-Pro–(empty)–OCS · en 2308, 3000
- Bordes del T-DNA · LB, RB
Ligation of p35-OCS-BM* into B473p6oM-LH*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Borde del T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P35S | Promotor misc_feature | 309 | 724 | 416 | + |
| Kozak | Sitio misc_feature | 740 | 744 | 5 | + |
| hptII | Marcador de selección CDS | 745 | 1314 | 570 | + |
| int | Sitio misc_feature | 1315 | 1503 | 189 | + |
| hptII | Marcador de selección CDS | 1504 | 1959 | 456 | + |
| TE9 | Terminador misc_feature | 1977 | 2267 | 291 | + |
| 35S-Pro | Promotor misc_feature | 2322 | 2744 | 423 | + |
| TATA | Sitio CDS | 2710 | 2716 | 7 | + |
| OCS | Terminador misc_feature | 2791 | 2986 | 196 | + |
| RB | Borde del T-DNA misc_feature | 3071 | 3094 | 24 | + |
| ColE1 | Origen / backbone misc_feature | 3629 | 4326 | 698 | + |
| pVS1 | Origen / backbone misc_feature | 4875 | 8580 | 3706 | + |
| Sm/Sp | Marcador de selección CDS | 8764 | 9774 | 1011 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
p6oM-35s-ocs (D389; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6oM-35s-ocs; RRID:SCR_029231)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.