p7o-LH-35s-ocs B424
Vector binario con 35s–bar, para dicotiledóneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 303 | entre LB y P35S |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 727 | entre P35S y bar |
| AarICACCTGC(4/8) | 1268 | en bar |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1796 | entre TE9 y P35S |
| NcoIC^CATGG | 1822 | entre TE9 y P35S |
| SpeIA^CTAGT | 2262 | en P35S |
| BamHIG^GATCC | 2269 | entre P35S y Tocs |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 2277 | entre P35S y Tocs |
| EcoRIG^AATTC | 2287 | entre P35S y Tocs |
| HindIIIA^AGCTT | 2293 | entre P35S y Tocs |
| SalIG^TCGAC | 2305 | entre P35S y Tocs |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2513 | entre Tocs y RB |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2515 | entre Tocs y RB |
| BglIIA^GATCT | 2525 | entre Tocs y RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2542 | entre Tocs y RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 2574 | entre Tocs y RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 2965 | entre RB y ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 7179 | en pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 7295 | en pVS1 |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 7375 | en pVS1 |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 8660 | en Sm/Sp |
Corte doble: PstI (1796, 2285), SphI (1802, 2699), NdeI (4080, 5839), MluI (1486, 2299), SfiI (1827, 2519), FseI (4846, 6951), MfeI (14, 1085), AgeI (7789, 8097), SacII (1368, 1385), SapI (4018, 7915).
Sin sitio: SacI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, NsiI, BsrGI, PvuII.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 1
- 35s
- Gen 1
- bar
- Promotor 2
- 35s
- Gen 2
- MCS
- Características
- dicotiledóneas
- Otros marcadores
- Sm/Sp
- Tamaño
- 9813 bp, circular
- Fecha del registro
- 22-JAN-2016
Construcción
- P35S–bar · TE9 · casete de selección, 309–1786
- P35S–(vacío)–Tocs · casete de expresión vacío, 1841–2505
- MCS · 6 sitios únicos · en 2262, 2305
- SfiI ×2 · flanquea el casete P35S–(empty)–Tocs · en 1827, 2519
- Bordes del T-DNA · LB, RB
Ligation of p35-OCS-BM* into B414p7o-LH*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Borde del T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P35S | Promotor misc_feature | 309 | 724 | 416 | + |
| bar | Marcador de selección CDS | 745 | 978 | 234 | + |
| int | Sitio misc_feature | 979 | 1167 | 189 | + |
| bar | Marcador de selección CDS | 1168 | 1483 | 316 | + |
| TE9 | Terminador misc_feature | 1496 | 1786 | 291 | + |
| P35S | Promotor misc_feature | 1841 | 2263 | 423 | + |
| Tocs | Terminador misc_feature | 2310 | 2505 | 196 | + |
| RB | Borde del T-DNA misc_feature | 2590 | 2613 | 24 | + |
| ColE1 | Origen / backbone misc_feature | 3148 | 3845 | 698 | + |
| bom | Origen / backbone misc_feature | 3882 | 4141 | 260 | + |
| pVS1 | Origen / backbone misc_feature | 4394 | 8099 | 3706 | + |
| Sm/Sp | Marcador de selección CDS | 8283 | 9293 | 1011 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
p7o-LH-35s-ocs (B424; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p7o-LH-35s-ocs; RRID:SCR_029231)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.