p9oUZm-UZmGFP C441
Vector binario con UbiZm–nptII y UbiZm–EGFP, para monocotiledóneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 2100 | en NptIIo |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2900 | entre E9 y Ubi |
| SpeIA^CTAGT | 2939 | entre E9 y Ubi |
| BamHIG^GATCC | 2945 | entre E9 y Ubi |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 2953 | entre E9 y Ubi |
| HindIIIA^AGCTT | 4471 | entre Ubi y GFP |
| MluIA^CGCGT | 4477 | entre Ubi y GFP |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 4834 | en GFP |
| SalIG^TCGAC | 5403 | entre GFP y OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 5611 | entre OCS y RB |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 5613 | entre OCS y RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 5672 | entre OCS y RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 6063 | entre RB y ColE1 |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 6184 | entre RB y ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 10.277 | en pVS1 |
Corte doble: SphI (2906, 5797), KpnI (4715, 5640), SfiI (2931, 5617), AgeI (10.887, 11.195), NsiI (1339, 4237), BstEII (2342, 11.758), SapI (7116, 11.013), AarI (2063, 2184).
Sin sitio: EcoRI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, HpaI, BsrGI, SacII, PvuII, XmnI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 1
- UbiZm
- Gen 1
- nptII
- Promotor 2
- UbiZm
- Gen 2
- EGFP
- Características
- monocotiledóneas
- Otros marcadores
- NptIIo, Sm/Sp
- Tamaño
- 13.159 bp, circular
- Fecha del registro
- 04-OCT-2017
Construcción
- Ubi–GFP · OCS · casete con inserto, 2961–5603
- MCS · 4 sitios únicos · en 2900, 2953
- SfiI ×2 · flanquea el casete Ubi–GFP · en 2931, 5617
- Bordes del T-DNA · LB, RB
Ligation of B595pUbiZm-mGFPM-ocs* into B480p9oUZm-LH*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| Ubi-int' | Secuencia codificante CDS | 62 | 1569 | 1508 | + |
| Intron | Sitio misc_feature | 1049 | 1568 | 520 | + |
| NptIIo | Marcador de selección CDS | 1590 | 1888 | 299 | + |
| Int | Sitio CDS | 1889 | 2075 | 187 | + |
| NptIIo | Marcador de selección CDS | 2076 | 2582 | 507 | + |
| E9 | Terminador misc_feature | 2600 | 2890 | 291 | + |
| Ubi | Promotor misc_feature | 2961 | 4468 | 1508 | + |
| Int | Sitio misc_feature | 3947 | 4466 | 520 | + |
| GFP | Secuencia codificante CDS | 4494 | 4872 | 379 | + |
| Int | Sitio CDS | 4873 | 5061 | 189 | + |
| GFP | Secuencia codificante CDS | 5062 | 5399 | 338 | + |
| OCS | Terminador misc_feature | 5408 | 5603 | 196 | + |
| RB | Borde del T-DNA misc_feature | 5688 | 5711 | 24 | + |
| ColE1 | Origen / backbone misc_feature | 6246 | 6943 | 698 | + |
| pVS1 | Origen / backbone misc_feature | 7492 | 11.197 | 3706 | + |
| Sm/Sp | Marcador de selección CDS | 11.381 | 12.391 | 1011 | + |
| LB | Borde del T-DNA misc_feature | 12.912 | 12.935 | 24 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
p9oUZm-UZmGFP (C441; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9oUZm-UZmGFP)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.