p7D35s-AEFC9 G645
Vector CRISPR/Cas con 35s–bar, para dicotiledóneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 587 | entre 35S y Bar'' |
| AarICACCTGC(4/8) | 1128 | en 'Bar' |
| MluIA^CGCGT | 1346 | entre 'Bar' y E9 |
| PstICTGCA^G | 1656 | entre E9 y EF1' |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1656 | entre E9 y EF1' |
| NotIGC^GGCCGC | 1665 | entre E9 y EF1' |
| NdeICA^TATG | 1715 | en EF1' |
| PacITTAAT^TAA | 1953 | en EF1' |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 2214 | en intron? |
| SpeIA^CTAGT | 2816 | entre EF1' y Cas9WT |
| BamHIG^GATCC | 2822 | entre EF1' y Cas9WT |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 2878 | en Cas9WT |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 4032 | en Cas9WT |
| NcoIC^CATGG | 4301 | en Cas9WT |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 7036 | entre Cas9WT y NOS-T |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 7159 | en NOS-T |
| EcoRIG^AATTC | 7296 | entre NOS-T y RNA' |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 7754 | en targetRNA |
| HindIIIA^AGCTT | 7757 | en targetRNA |
| SalIG^TCGAC | 7857 | entre RNA' y Right Border Region |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 7899 | entre RNA' y Right Border Region |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 7931 | en Right Border Region |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 11.734 | en strep/spec |
Corte doble: XbaI (163, 1861), SphI (6145, 8056), BglII (3129, 7877), ClaI (2346, 2417), SfiI (1664, 7871), MfeI (14, 945), EagI (1665, 8313), PvuI (8266, 11.955), AatII (3420, 8322).
Sin sitio: NheI, AscI, FseI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, BsrGI, BsaI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 1
- 35s
- Gen 1
- bar
- Características
- dicotiledóneas
- Otros marcadores
- Bar'', 'Bar', strep/spec
- Tamaño
- 12.584 bp, circular
- Fecha del registro
- 02-APR-2025
Construcción
- 35S–Bar · E9 · casete de selección, 169–1646
- MCS · 4 sitios únicos · en 1656, 1715
- SfiI ×2 · flanquea el MCS · en 1664, 7871
- Bordes del T-DNA · LB, RB
Ligation of G473p7bm-CBEhAi-AtEF1* into D023p7D35s-C9wt-U6At*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| LB' | Borde del T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| 35S | Promotor misc_feature | 169 | 584 | 416 | + |
| Bar'' | Marcador de selección CDS | 605 | 838 | 234 | + |
| STLS1 | Otro misc_feature | 839 | 1027 | 189 | + |
| ''Bar' | Marcador de selección CDS | 1028 | 1343 | 316 | + |
| 'E9 | Terminador misc_feature | 1356 | 1646 | 291 | + |
| EF1' | Otro misc_feature | 1672 | 2816 | 1145 | + |
| sin nombre | Otro source | 1672 | 2816 | 1145 | + |
| splice | Sitio misc_feature | 2023 | 2026 | 4 | + |
| sin nombre | Otro exon | 2151 | 2816 | 666 | + |
| aggt | Sitio misc_feature | 2204 | 2207 | 4 | + |
| intron? | Secuencia codificante CDS | 2206 | 2807 | 602 | + |
| splice? | Sitio misc_feature | 2806 | 2809 | 4 | + |
| 'Cas9WT | Secuencia codificante CDS | 2837 | 7033 | 4197 | + |
| NLS | Sitio misc_feature | 2843 | 2863 | 21 | + |
| NLS | Sitio misc_feature | 6983 | 7030 | 48 | + |
| NOS-T | Terminador misc_feature | 7039 | 7292 | 254 | + |
| 'RNA' | Otro misc_feature | 7297 | 7857 | 561 | + |
| U6At | Secuencia codificante CDS | 7302 | 7746 | 445 | + |
| targetRNA | Sitio CDS | 7747 | 7773 | 27 | + |
| hairpin | Sitio CDS | 7774 | 7803 | 30 | + |
| gRNA | Sitio misc_feature | 7774 | 7856 | 83 | + |
| Right Border Region | Otro misc_feature | 7902 | 8504 | 603 | + |
| RB | Borde del T-DNA misc_feature | 7947 | 7970 | 24 | + |
| 'ColE1'' | Origen / backbone misc_feature | 8518 | 9176 | 659 | + |
| ''pVS1 ORI''' | Origen / backbone misc_feature | 9205 | 11.168 | 1964 | + |
| ParB | Secuencia codificante CDS | 9531 | 10.706 | 1176 | + |
| strep/spec | Marcador de selección CDS | 11.357 | 12.367 | 1011 | + |
| Left Border Region | Borde del T-DNA misc_feature | 12.435 | 163 | 0 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
p7D35s-AEFC9 (G645; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/crispr/p7D35s-AEFC9)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.