pHC5-TPea-Sfi-Kpn F106
Vector de clonación pUC.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| NcoIC^CATGG | 128 | entre O1 y Pea3A(T) |
| BglIIA^GATCT | 139 | entre O1 y Pea3A(T) |
| AvrII (XmaJI)C^CTAGG | 150 | entre O1 y Pea3A(T) |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 165 | entre O1 y Pea3A(T) |
| AscI (SgsI)GG^CGCGCC | 173 | entre O1 y Pea3A(T) |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 183 | en Pea3A(T) |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 239 | en Pea3A(T) |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 653 | entre Pea3A(T) y O2 |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 658 | entre Pea3A(T) y O2 |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 740 | entre O2 y ORF-1 |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 948 | en ORF-1 |
| PvuICGAT^CG | 1179 | en ORF-1 |
Corte doble: SfiI (133, 662).
Sin sitio: EcoRI, BamHI, HindIII, XbaI, SalI, PstI, SphI, SmaI, NotI, XhoI, NdeI, SpeI, NheI, ClaI, ApaI, MluI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, BsiWI, MfeI, AgeI, BstBI, HpaI, BsrGI, EagI, SacII, PvuII, AatII, BstEII, BsaI, BbsI, BsmBI, SapI, AarI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Gen 2
- MCS
- Tamaño
- 2231 bp, circular
- Fecha del registro
- 09-JUN-2022
Construcción
- MCS · 6 sitios únicos · en 128, 183
- SfiI ×2 · flanquea el MCS · en 133, 662
F106pHC5-TPea-Sfi-Kpn rotated to position 2175
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| O1 | Sitio CDS | 87 | 107 | 21 | + |
| Pea3A(T) | Otro misc_feature | 180 | 648 | 469 | + |
| O2 | Sitio CDS | 686 | 706 | 21 | + |
| ORF-1 | Secuencia codificante CDS | 761 | 1621 | 861 | + |
| ColE1 | Sitio misc_feature | 1624 | 57 | 0 | + |
| LC | Sitio misc_feature | 1846 | 1846 | 1 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
pHC5-TPea-Sfi-Kpn (F106; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pHC5-TPea-Sfi-Kpn)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.