pUbiM-dmolgusI 986
Vector de clonación pUC con UbiZm–oGus, para monocotiledóneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| PacITTAAT^TAA | 58 | entre ColE1 y Ubi-int |
| NotIGC^GGCCGC | 64 | entre ColE1 y Ubi-int |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 64 | entre ColE1 y Ubi-int |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 776 | en Ubi-int |
| NcoIC^CATGG | 1123 | en Intron |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 1136 | en Intron |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 1196 | en Intron |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 1309 | en Intron |
| SpeIA^CTAGT | 1586 | entre Intron y dmoLgus' |
| BamHIG^GATCC | 1593 | entre Intron y dmoLgus' |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1601 | entre Intron y dmoLgus' |
| HindIIIA^AGCTT | 1623 | entre Intron y dmoLgus' |
| MluIA^CGCGT | 1629 | entre Intron y dmoLgus' |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 1642 | entre Intron y dmoLgus' |
| AarICACCTGC(4/8) | 2443 | en Intron |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 2551 | en 'dmoLgus |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 2629 | en 'dmoLgus |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 3711 | entre 'dmoLgus y NOS |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3749 | en NOS |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3977 | entre NOS y Amp |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 3982 | entre NOS y Amp |
Corte doble: XbaI (109, 1104), SalI (1635, 3714), BglII (1023, 2654), SfiI (48, 3995), MfeI (310, 2373), StuI (3157, 3998), NsiI (1354, 3840), XmnI (3288, 4242), BsaI (2885, 4776).
Sin sitio: EcoRI, SphI, AscI, SbfI, FseI, PmeI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, BsrGI, SacII, PvuII, BstEII, BbsI, BsmBI, SapI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 2
- UbiZm
- Gen 2
- oGus
- Características
- GUS-intrón optimizado para la transformación de monocotiledóneas
- Otros marcadores
- Amp
- Tamaño
- 5572 bp, circular
- Fecha del registro
- 20-JUN-2013
Construcción
- Ubi-int–dmoLgus–Amp · casete con inserto, 77–4917
- MCS · 6 sitios únicos · en 1586, 1642
Ligation of dmG1-GInt-dmG2* into 955pUbiM-dmoLgus*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| Ubi-int | Promotor misc_feature | 77 | 1063 | 987 | + |
| Intron | Sitio misc_feature | 1064 | 1583 | 520 | + |
| dmoLgus' | Secuencia codificante CDS | 1652 | 2266 | 615 | + |
| 'Intron | Sitio misc_feature | 2267 | 2455 | 189 | + |
| ''dmoLgus | Secuencia codificante CDS | 2456 | 3652 | 1197 | + |
| NOS | Otro misc_feature | 3720 | 3973 | 254 | + |
| Amp | Marcador de selección CDS | 4055 | 4917 | 863 | + |
| ColE1 | Sitio misc_feature | 4918 | 10 | 0 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
pUbiM-dmolgusI (986; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pUbiM-dmolgusI)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.