pUbiZm-LRFP B647
Vector de clonación pUC con UbiZm–Link-RFP, para monocotiledóneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 77 | entre ColE1 y UbiZm |
| NotIGC^GGCCGC | 93 | entre ColE1 y UbiZm |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 93 | entre ColE1 y UbiZm |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 339 | en UbiZm |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 805 | en UbiZm |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 1225 | en int |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 1338 | en int |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 1383 | en int |
| SpeIA^CTAGT | 1615 | entre UbiZm y link |
| BamHIG^GATCC | 1622 | entre UbiZm y link |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1630 | entre UbiZm y link |
| EcoRIG^AATTC | 1640 | entre UbiZm y link |
| HindIIIA^AGCTT | 1646 | entre UbiZm y link |
| MluIA^CGCGT | 1652 | entre UbiZm y link |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 1658 | entre UbiZm y link |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 2098 | en rfp |
| BbsI (BpiI)GAAGAC(2/6) | 2138 | en rfp |
| SalIG^TCGAC | 2429 | entre rfp y Tocs |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 2449 | en Tocs |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2637 | entre Tocs y Amp |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2639 | entre Tocs y Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2666 | entre Tocs y Amp |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 3632 | en Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 5237 | entre ColE1 y UbiZm |
Corte doble: NcoI (87, 1152), BglII (1052, 2649), ApaI (1165, 2660), SfiI (92, 2643), PvuII (2787, 5300).
Sin sitio: SphI, EcoRV, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, SacII, AatII, BstEII, AarI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 2
- UbiZm
- Gen 2
- Link-RFP
- Características
- monocotiledóneas
- Otros marcadores
- Amp
- Tamaño
- 5445 bp, circular
- Fecha del registro
- 08-FEB-2016
Construcción
- UbiZm–rfp · Tocs · casete con inserto, 106–2629
- MCS · 7 sitios únicos · en 1615, 1658
- SfiI ×2 · flanquea el casete UbiZm–rfp · en 92, 2643
Ligation of TagRFP-Mlu-Sal* into B633pUbiZm-LGFP*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| UbiZm | Promotor misc_feature | 106 | 1614 | 1509 | + |
| int | Sitio misc_feature | 1093 | 1612 | 520 | + |
| link | Otro misc_feature | 1664 | 1714 | 51 | + |
| rfp | Secuencia codificante CDS | 1715 | 2428 | 714 | + |
| Tocs | Terminador misc_feature | 2434 | 2629 | 196 | + |
| Amp | Marcador de selección misc_feature | 3445 | 4305 | 861 | + |
| ColE1 | Origen / backbone CDS | 4348 | 5064 | 717 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
pUbiZm-LRFP (B647; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pUbiZm-LRFP; RRID:SCR_029231)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.