pmGFPD-nos B445
Vector de clonación pUC con MCS–GFP, para dicotiledóneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 103 | entre ColE1 y gfp |
| XbaIT^CTAGA | 105 | entre ColE1 y gfp |
| NcoIC^CATGG | 113 | entre ColE1 y gfp |
| NotIGC^GGCCGC | 119 | entre ColE1 y gfp |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 119 | entre ColE1 y gfp |
| SpeIA^CTAGT | 126 | entre ColE1 y gfp |
| BamHIG^GATCC | 132 | entre ColE1 y gfp |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 140 | entre ColE1 y gfp |
| PstICTGCA^G | 148 | entre ColE1 y gfp |
| EcoRIG^AATTC | 150 | entre ColE1 y gfp |
| HindIIIA^AGCTT | 156 | entre ColE1 y gfp |
| MluIA^CGCGT | 162 | entre ColE1 y gfp |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 519 | en gfp |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 664 | en int |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 750 | en gfp |
| SalIG^TCGAC | 1088 | entre gfp y Tnos |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 1226 | en Tnos |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 1368 | entre Tnos y Amp |
| BglIIA^GATCT | 1380 | entre Tnos y Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 1391 | entre Tnos y Amp |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 2363 | en Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 2897 | en Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 3968 | entre ColE1 y gfp |
Corte doble: KpnI (400, 1397), SfiI (118, 1374), AflII (1135, 1370), PvuII (1518, 4031).
Sin sitio: SphI, XhoI, NdeI, NheI, EcoRV, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, HpaI, BsrGI, SacII, AatII, BstEII, BbsI, BsmBI, AarI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 2
- MCS
- Gen 2
- GFP
- Características
- dicotiledóneas
- Otros marcadores
- Amp
- Tamaño
- 4150 bp, circular
- Fecha del registro
- 22-JAN-2016
Construcción
- MCS · 12 sitios únicos · en 103, 162
- SfiI ×2 · flanquea el MCS · en 118, 1374
Ligation of GFPdi-Hind-Sal* into pNos-BM*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| gfp | Secuencia codificante CDS | 179 | 557 | 379 | + |
| int | Sitio CDS | 558 | 746 | 189 | + |
| gfp | Secuencia codificante CDS | 747 | 1084 | 338 | + |
| Tnos | Terminador misc_feature | 1106 | 1359 | 254 | + |
| Amp | Marcador de selección misc_feature | 2176 | 3036 | 861 | + |
| ColE1 | Origen / backbone CDS | 3079 | 3795 | 717 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
pmGFPD-nos (B445; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pmGFPD-nos; RRID:SCR_029231)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.