p4oUZm-LH B476
Vecteur binaire avec UbiZm–AHAS, pour les monocotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 4 357 | entre TE9 et RB |
| SpeIA^CTAGT | 4 396 | entre TE9 et RB |
| BamHIG^GATCC | 4 402 | entre TE9 et RB |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 4 410 | entre TE9 et RB |
| EcoRIG^AATTC | 4 420 | entre TE9 et RB |
| HindIIIA^AGCTT | 4 426 | entre TE9 et RB |
| SalIG^TCGAC | 4 438 | entre TE9 et RB |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 4 448 | entre TE9 et RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 4 475 | entre TE9 et RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 4 507 | entre TE9 et RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 4 898 | entre RB et ColE1 |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 5 019 | entre RB et ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 9 112 | dans pVS1 |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 10 593 | dans Sm/Sp |
Double coupure : SphI (4 363, 4 632), XhoI (1 009, 1 820), NcoI (1 356, 4 383), NheI (1 429, 9 228), ApaI (1 369, 4 469), SfiI (4 388, 4 452), FseI (6 779, 8 884), AgeI (9 722, 10 030), StuI (2 738, 4 446), NsiI (1 587, 4 418), SapI (5 951, 9 848).
Aucun site : SacI, MluI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, BsrGI, SacII, PvuII, XmnI, AarI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- UbiZm
- Gène 1
- AHAS
- Caractéristiques
- monocotylédones
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 11 746 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 22-JAN-2016
Construction
- MCS · 10 sites uniques · en 4 357, 4 507
- SfiI ×2 · encadre le MCS · en 4 388, 4 452
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of UbiZm-Bsa* into B471p4oM-LH*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| UbiZm | Séquence codante CDS | 310 | 1 817 | 1 508 | + |
| int | Site misc_feature | 1 297 | 1 816 | 520 | + |
| ahas | Séquence codante CDS | 1 838 | 2 476 | 639 | + |
| int | Site CDS | 2 477 | 2 665 | 189 | + |
| ahas | Séquence codante CDS | 2 666 | 4 039 | 1 374 | + |
| TE9 | Terminateur misc_feature | 4 057 | 4 347 | 291 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 4 523 | 4 546 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 5 081 | 5 778 | 698 | + |
| pVS1 | Origine / squelette misc_feature | 6 327 | 10 032 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 10 216 | 11 226 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p4oUZm-LH (B476; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p4oUZm-LH)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.