p5oM-LH B472
Vecteur binaire avec 35s–EPSPS, pour les monocotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 303 | entre LB et P35S |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 594 | dans P35S |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 727 | entre P35S et EPSPS |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 2 153 | dans epsps |
| MluIA^CGCGT | 2 517 | entre epsps et TE9 |
| PstICTGCA^G | 2 827 | entre TE9 et RB |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2 827 | entre TE9 et RB |
| NcoIC^CATGG | 2 853 | entre TE9 et RB |
| SpeIA^CTAGT | 2 866 | entre TE9 et RB |
| BamHIG^GATCC | 2 872 | entre TE9 et RB |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 2 880 | entre TE9 et RB |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 2 888 | entre TE9 et RB |
| EcoRIG^AATTC | 2 890 | entre TE9 et RB |
| HindIIIA^AGCTT | 2 896 | entre TE9 et RB |
| SalIG^TCGAC | 2 908 | entre TE9 et RB |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2 916 | entre TE9 et RB |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2 918 | entre TE9 et RB |
| BglIIA^GATCT | 2 928 | entre TE9 et RB |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 2 939 | entre TE9 et RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2 945 | entre TE9 et RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 2 977 | entre TE9 et RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 3 368 | entre RB et ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 7 582 | dans pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 7 698 | dans pVS1 |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 9 063 | dans Sm/Sp |
Double coupure : SphI (2 833, 3 102), NdeI (4 483, 6 242), ClaI (2 903, 7 778), EcoRV (634, 3 489), SfiI (2 858, 2 922), FseI (5 249, 7 354), MfeI (14, 1 592), AgeI (8 192, 8 500), SapI (4 421, 8 318).
Aucun site : SacI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, BsrGI, PvuII, AarI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- 35s
- Gène 1
- EPSPS
- Caractéristiques
- monocotylédones
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 10 216 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 22-JAN-2016
Construction
- P35S–EPSPS · TE9 · cassette de sélection, 309–2 817
- MCS · 16 sites uniques · en 2 827, 2 977
- SfiI ×2 · encadre le MCS · en 2 858, 2 922
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
B472p5oM-LH rotated to position 9969
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P35S | Promoteur misc_feature | 309 | 724 | 416 | + |
| EPSPS | Séquence codante CDS | 745 | 1 485 | 741 | + |
| int | Site misc_feature | 1 486 | 1 674 | 189 | + |
| epsps | Séquence codante CDS | 1 675 | 2 517 | 843 | + |
| TE9 | Terminateur misc_feature | 2 527 | 2 817 | 291 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 2 993 | 3 016 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 3 551 | 4 248 | 698 | + |
| pVS1 | Origine / squelette misc_feature | 4 797 | 8 502 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 8 686 | 9 696 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p5oM-LH (B472; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p5oM-LH)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.