p5oU10-LGFPi-2 B639
Vecteur binaire avec Ubq10–EPSPS, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 570 | dans UBQ10 |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 1 402 | dans UBQ10 |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 1 786 | entre UBQ10 et cpt |
| PvuIICAG^CTG | 1 946 | dans cpt |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 3 224 | dans epsps |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 3 898 | entre TE9 et link |
| NcoIC^CATGG | 3 924 | entre TE9 et link |
| SpeIA^CTAGT | 3 937 | entre TE9 et link |
| BamHIG^GATCC | 3 943 | entre TE9 et link |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 3 951 | entre TE9 et link |
| HindIIIA^AGCTT | 3 967 | entre TE9 et link |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 3 979 | entre TE9 et link |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 4 376 | dans gfpm |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 5 154 | entre Tocs et RB |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 5 156 | entre Tocs et RB |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 5 177 | entre Tocs et RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 5 183 | entre Tocs et RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 5 215 | entre Tocs et RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 5 606 | entre RB et ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 9 820 | dans pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 9 936 | dans pVS1 |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 11 301 | dans Sm/Sp |
Double coupure : EcoRI (969, 3 961), SalI (1 147, 4 946), PstI (3 898, 3 959), SphI (3 904, 5 340), NdeI (6 721, 8 480), BglII (1 714, 5 166), ClaI (4 607, 10 016), MluI (3 588, 3 973), SfiI (3 929, 5 160), FseI (7 487, 9 592), AgeI (10 430, 10 738).
Aucun site : AscI, PacI, SwaI, AvrII, HpaI, NsiI, AarI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- Ubq10
- Gène 1
- EPSPS
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 12 454 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 08-FEB-2016
Construction
- UBQ10–cpt–EPSPS · TE9 · cassette avec insert, 309–3 888
- MCS · 7 sites uniques · en 3 898, 3 979
- SfiI ×2 · encadre le MCS · en 3 929, 5 160
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of B636pLGFP-ocs* into B638p5oU10-2*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| UBQ10 | Autre misc_feature | 309 | 1 784 | 1 476 | + |
| Ubi cds 5 | Promoteur misc_feature | 1 413 | 1 476 | 64 | + |
| int | Site misc_feature | 1 479 | 1 782 | 304 | + |
| cpt | Séquence codante CDS | 1 804 | 2 022 | 219 | + |
| EPSPS | Séquence codante CDS | 1 804 | 2 556 | 753 | + |
| int | Site misc_feature | 2 557 | 2 745 | 189 | + |
| epsps | Séquence codante CDS | 2 746 | 3 588 | 843 | + |
| TE9 | Terminateur misc_feature | 3 598 | 3 888 | 291 | + |
| link | Site misc_signal | 3 985 | 4 035 | 51 | + |
| gfpm | Séquence codante CDS | 4 036 | 4 414 | 379 | + |
| int | Site CDS | 4 415 | 4 603 | 189 | + |
| gfpm | Séquence codante CDS | 4 604 | 4 941 | 338 | + |
| Tocs | Terminateur misc_feature | 4 951 | 5 146 | 196 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 5 231 | 5 254 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 5 789 | 6 486 | 698 | + |
| bom | Origine / squelette misc_feature | 6 523 | 6 782 | 260 | + |
| pVS1 | Origine / squelette misc_feature | 7 035 | 10 740 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 10 924 | 11 934 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p5oU10-LGFPi-2 (B639; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p5oU10-LGFPi-2)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.