Binaires · Cassettes multiples
p6M2x35s-UbiZ-UbiZ H260
Vecteur binaire avec 2x35s–hptII, pour les monocotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2 508 | entre E9 et Ubi-int |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 2 526 | entre E9 et Ubi-int |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 2 533 | entre E9 et Ubi-int |
| AscI (SgsI)GG^CGCGCC | 4 066 | entre Ubi-int et Thsp17 |
| AvrII (XmaJI)C^CTAGG | 5 821 | entre Ubi-int et T35S |
| MluIA^CGCGT | 5 833 | entre Ubi-int et T35S |
| NotIGC^GGCCGC | 6 050 | entre T35S et Right Border Region |
| PacITTAAT^TAA | 6 062 | entre T35S et Right Border Region |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 6 101 | entre T35S et Right Border Region |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 6 133 | dans Right Border Region |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 6 258 | dans Right Border Region |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 6 524 | dans Right Border Region |
Double coupure : NcoI (3 584, 5 355), NheI (3 657, 5 428), ClaI (3 770, 5 541), EcoRV (826, 6 645), SfiI (2 516, 6 073), StuI (1 872, 2 510), NsiI (3 815, 5 586), EagI (6 050, 6 515), SacII (1 346, 2 176).
Aucun site : EcoRI, BamHI, HindIII, SalI, SacI, SmaI, SpeI, FseI, AgeI, BstBI, HpaI, AflII, BsrGI, PvuII, BsaI, BsmBI, SapI, AarI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- 2x35s
- Gène 1
- hptII
- Promoteur 2
- UbiZm
- Caractéristiques
- monocotylédones
- Autres marqueurs
- hptII'', strep/spec
- Taille
- 10 786 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 17-JUN-2026
Construction
- P2x35s–hptII · E9 · cassette de sélection, 174–2 498
- Ubi-int–(vide)–Thsp17 · cassette d’expression vide, 2 539–4 280
- Ubi-int–(vide)–T35S · cassette d’expression vide, 4 310–6 044
- MCS · 4 sites uniques · en 6 050, 6 133
- SfiI ×2 · encadre 2 cassettes · en 2 516, 6 073
- AscI/PacI · un site chacun · en 4 066, 6 062
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of F517pBA-2xUbiZm2* into C241p6M2x35s*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB' | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P2x35s' | Promoteur misc_feature | 174 | 958 | 785 | + |
| Kozak | Site misc_feature | 971 | 975 | 5 | + |
| hptII | Marqueur de sélection CDS | 976 | 1 545 | 570 | + |
| int | Site misc_feature | 1 546 | 1 734 | 189 | + |
| 'hptII'' | Marqueur de sélection CDS | 1 735 | 2 190 | 456 | + |
| 'E9 | Terminateur misc_feature | 2 208 | 2 498 | 291 | + |
| 'Ubi-int | Promoteur misc_feature | 2 539 | 4 046 | 1 508 | + |
| Intron | Site misc_feature | 3 525 | 4 044 | 520 | + |
| 'Thsp17 | Autre misc_feature | 4 074 | 4 280 | 207 | + |
| 'Ubi-int | Promoteur misc_feature | 4 310 | 5 817 | 1 508 | + |
| Intron | Site misc_feature | 5 296 | 5 815 | 520 | + |
| T35S | Terminateur misc_feature | 5 843 | 6 044 | 202 | + |
| Right Border Region | Autre misc_feature | 6 104 | 6 706 | 603 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 6 149 | 6 172 | 24 | + |
| 'ColE1'' | Origine / squelette misc_feature | 6 720 | 7 378 | 659 | + |
| ''pVS1 ORI''' | Origine / squelette misc_feature | 7 407 | 9 370 | 1 964 | + |
| ParB | Séquence codante CDS | 7 733 | 8 908 | 1 176 | + |
| strep/spec | Marqueur de sélection CDS | 9 559 | 10 569 | 1 011 | + |
| Left Border Region | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 10 637 | 163 | 0 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p6M2x35s-UbiZ-UbiZ (H260; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6M2x35s-UbiZ-UbiZ; RRID:SCR_029231)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.