p6i
Vecteur binaire avec 35s–hptII, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 1 | à côté de 35S |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 292 | dans 35S |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 425 | entre 35S et hpt |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 1 421 | dans hpt |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1 899 | entre T35S et BR |
| SpeIA^CTAGT | 1 938 | entre T35S et BR |
| BamHIG^GATCC | 1 944 | entre T35S et BR |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 1 960 | entre T35S et BR |
| HindIIIA^AGCTT | 1 968 | entre T35S et BR |
| SalIG^TCGAC | 1 980 | entre T35S et BR |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 1 988 | entre T35S et BR |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 1 990 | entre T35S et BR |
| BglIIA^GATCT | 2 000 | entre T35S et BR |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2 017 | entre T35S et BR |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 2 049 | entre T35S et BR |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 6 654 | dans pVS1 ORI |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 6 770 | dans pVS1 ORI |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 8 135 | dans Sm/Sp |
Double coupure : EcoRI (695, 1 962), PstI (789, 1 899), SphI (1 905, 2 174), SmaI (436, 1 952), NcoI (804, 1 925), ClaI (1 975, 6 850), EcoRV (332, 2 561), ApaI (434, 2 011), SfiI (1 930, 1 994), FseI (4 321, 6 426), MfeI (976, 9 302), AgeI (7 264, 7 572), AatII (479, 2 440), BsaI (7 173, 7 593), SapI (3 493, 7 390).
Aucun site : SacI, MluI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, BsrGI, PvuII, AarI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- 35s
- Gène 1
- hptII
- Gène 2
- MCS
- Caractéristiques
- dicotylédones, hptII avec intron STLS1
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 9 590 bp, linéaire
- Date de l’enregistrement
- 11-JAN-2005
Construction
- 35S–hpt · T35S · cassette de sélection, 7–1 892
- MCS · 11 sites uniques · en 1 899, 2 049
- SfiI ×2 · encadre la cassette 35S–hpt · en 1 930, 1 994
Ligation of Hyg-int* into pLH6000*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| 35S | Promoteur misc_feature | 7 | 422 | 416 | + |
| hpt | Marqueur de sélection misc_feature | 452 | 869 | 418 | + |
| (null) | Site CDS | 861 | 884 | 24 | + |
| STLS1 | Autre misc_feature | 870 | 1 058 | 189 | + |
| (null) | Site CDS | 859 | 884 | 26 | − |
| (null) | Site CDS | 1 047 | 1 074 | 28 | + |
| hpt | Marqueur de sélection misc_feature | 1 059 | 1 666 | 608 | + |
| (null) | Site CDS | 1 047 | 1 072 | 26 | − |
| T35S | Terminateur misc_feature | 1 691 | 1 892 | 202 | + |
| BR | Site misc_feature | 2 065 | 2 088 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 2 623 | 3 320 | 698 | + |
| pVS1 ORI | Origine / squelette misc_feature | 3 869 | 7 574 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 7 758 | 8 768 | 1 011 | + |
| BL | Site misc_feature | 9 289 | 9 312 | 24 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p6i (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6i; RRID:SCR_029231)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.
Utilisé dans
- A simple and highly efficient Agrobacterium-mediated transformation protocol for Setaria viridis – Martins PK, Ribeiro AP, Cunha BADBd, et al., Biotechnology Reports 2015; 6:41–44