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DNA Cloning Service
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Binaires

p6i

Vecteur binaire avec 35s–hptII, pour les dicotylédones.

123456789pVS1 ORISm/SpColE1hpthpt35ST35SSTLS1XbaI (1)XmnI, XhoISacII (1421)SbfI, SpeI, BamHI, NsiIHindIII, SalI, StuI, AflIIBglII, KpnI, PmeIBsiWI, NheIBstEII (8135)p6int9 590 bp

GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq

S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.

Sites de restriction

Enzyme à coupure unique · siteCoupe enEmplacement
XbaIT^CTAGA1à côté de 35S
XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC292dans 35S
XhoI (PaeR7I)C^TCGAG425entre 35S et hpt
SacII (Cfr42I)CCGC^GG1 421dans hpt
SbfI (SdaI)CCTGCA^GG1 899entre T35S et BR
SpeIA^CTAGT1 938entre T35S et BR
BamHIG^GATCC1 944entre T35S et BR
NsiI (Mph1103I)ATGCA^T1 960entre T35S et BR
HindIIIA^AGCTT1 968entre T35S et BR
SalIG^TCGAC1 980entre T35S et BR
StuI (Eco147I)AGG^CCT1 988entre T35S et BR
AflII (BspTI)C^TTAAG1 990entre T35S et BR
BglIIA^GATCT2 000entre T35S et BR
KpnI (Acc65I)GGTAC^C2 017entre T35S et BR
PmeI (MssI)GTTT^AAAC2 049entre T35S et BR
BsiWI (Pfl23II)C^GTACG6 654dans pVS1 ORI
NheI (BmtI)G^CTAGC6 770dans pVS1 ORI
BstEII (Eco91I)G^GTNACC8 135dans Sm/Sp

Double coupure : EcoRI (695, 1 962), PstI (789, 1 899), SphI (1 905, 2 174), SmaI (436, 1 952), NcoI (804, 1 925), ClaI (1 975, 6 850), EcoRV (332, 2 561), ApaI (434, 2 011), SfiI (1 930, 1 994), FseI (4 321, 6 426), MfeI (976, 9 302), AgeI (7 264, 7 572), AatII (479, 2 440), BsaI (7 173, 7 593), SapI (3 493, 7 390).

Aucun site : SacI, MluI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, BsrGI, PvuII, AarI.

Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.

Promoteur 1
35s
Gène 1
hptII
Gène 2
MCS
Caractéristiques
dicotylédones, hptII avec intron STLS1
Autres marqueurs
Sm/Sp
Taille
9 590 bp, linéaire
Date de l’enregistrement
11-JAN-2005

Construction

  • 35S–hpt · T35S · cassette de sélection, 7–1 892
  • MCS · 11 sites uniques · en 1 899, 2 049
  • SfiI ×2 · encadre la cassette 35S–hpt · en 1 930, 1 994

Ligation of Hyg-int* into pLH6000*

Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.

Éléments annotés

ÉlémentTypeDébutFinLongueurBrin
35SPromoteur misc_feature7422416+
hptMarqueur de sélection misc_feature452869418+
(null)Site CDS86188424+
STLS1Autre misc_feature8701 058189+
(null)Site CDS85988426−
(null)Site CDS1 0471 07428+
hptMarqueur de sélection misc_feature1 0591 666608+
(null)Site CDS1 0471 07226−
T35STerminateur misc_feature1 6911 892202+
BRSite misc_feature2 0652 08824+
ColE1Origine / squelette misc_feature2 6233 320698+
pVS1 ORIOrigine / squelette misc_feature3 8697 5743 706+
Sm/SpMarqueur de sélection CDS7 7588 7681 011+
BLSite misc_feature9 2899 31224+

PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite

Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.

Comment citer

Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.

p6i (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6i; RRID:SCR_029231)

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