p6iU
Vecteur binaire avec UbiZm–hptII, pour les monocotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 709 | dans Ubi-int |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 2 513 | dans hpt |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2 991 | entre T35S et BR |
| SpeIA^CTAGT | 3 030 | entre T35S et BR |
| BamHIG^GATCC | 3 036 | entre T35S et BR |
| HindIIIA^AGCTT | 3 060 | entre T35S et BR |
| SalIG^TCGAC | 3 072 | entre T35S et BR |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 3 080 | entre T35S et BR |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3 082 | entre T35S et BR |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3 109 | entre T35S et BR |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 3 141 | entre T35S et BR |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 3 653 | entre BR et ColE1 |
| BbsI (BpiI)GAAGAC(2/6) | 4 942 | entre ColE1 et pVS1 ORI |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 7 746 | dans pVS1 ORI |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 9 227 | dans Sm/Sp |
Double coupure : EcoRI (1 787, 3 054), XbaI (42, 1 037), SphI (2 997, 3 266), SmaI (1 528, 3 044), NheI (1 129, 7 862), BglII (956, 3 092), SfiI (3 022, 3 086), FseI (5 413, 7 518), AgeI (8 356, 8 664), NsiI (1 287, 3 052), AatII (1 571, 3 532), BsaI (8 265, 8 685), SapI (4 585, 8 482).
Aucun site : SacI, MluI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, BsrGI, PvuII, XmnI, AarI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- UbiZm
- Gène 1
- hptII
- Gène 2
- MCS
- Caractéristiques
- monocotylédones, hptII avec intron STLS1
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 10 682 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 09-JUN-2008
Construction
- Ubi-int–hpt · T35S · cassette de sélection, 10–2 984
- MCS · 9 sites uniques · en 2 991, 3 141
- SfiI ×2 · encadre le MCS · en 3 022, 3 086
Ligation of Ubi into p6int*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| Ubi-int | Promoteur misc_feature | 10 | 1 517 | 1 508 | + |
| Intron | Site misc_feature | 997 | 1 516 | 520 | + |
| hpt | Marqueur de sélection CDS | 1 544 | 1 961 | 418 | + |
| STLS1 | Autre misc_feature | 1 962 | 2 150 | 189 | + |
| hpt | Marqueur de sélection CDS | 2 151 | 2 758 | 608 | + |
| T35S | Terminateur misc_feature | 2 783 | 2 984 | 202 | + |
| BR | Site misc_feature | 3 157 | 3 180 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 3 715 | 4 412 | 698 | + |
| pVS1 ORI | Origine / squelette misc_feature | 4 961 | 8 666 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 8 850 | 9 860 | 1 011 | + |
| BL | Site misc_feature | 10 381 | 10 404 | 24 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p6iU (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6iU; RRID:SCR_029231)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.