p6o2x35s-UbiZm-LH B514
Vecteur binaire avec 2x35s–hptII, pour les monocotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2 012 | dans hptII |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2 648 | entre TE9 et UbiZm |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 2 689 | entre TE9 et UbiZm |
| SpeIA^CTAGT | 4 210 | entre UbiZm et Tnos |
| BamHIG^GATCC | 4 216 | entre UbiZm et Tnos |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 4 224 | entre UbiZm et Tnos |
| EcoRIG^AATTC | 4 234 | entre UbiZm et Tnos |
| HindIIIA^AGCTT | 4 240 | entre UbiZm et Tnos |
| MluIA^CGCGT | 4 246 | entre UbiZm et Tnos |
| SalIG^TCGAC | 4 252 | entre UbiZm et Tnos |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 4 299 | dans Tnos |
| PacITTAAT^TAA | 4 564 | entre Tnos et RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 4 630 | entre Tnos et RB |
Double coupure : KpnI (4 541, 4 598), XhoI (1 098, 3 400), NcoI (2 674, 3 747), NheI (3 820, 9 351), BglII (3 647, 4 581), ClaI (3 933, 9 431), EcoRV (966, 5 142), ApaI (3 760, 4 592), SfiI (2 679, 4 575), FseI (6 902, 9 007), BsiWI (2 696, 9 235), AgeI (9 845, 10 153), NsiI (3 978, 4 390), SacII (1 486, 2 316), AatII (4 548, 5 021), BstEII (1 406, 10 716), BsmBI (6 314, 7 367), SapI (6 074, 9 971).
Aucun site : SacI, AscI, AvrII, BstBI, HpaI, BsrGI, PvuII, AarI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- 2x35s
- Gène 1
- hptII
- Promoteur 2
- UbiZm
- Gène 2
- MCS
- Caractéristiques
- monocotylédones
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 11 869 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 08-FEB-2016
Construction
- P2x35s–hptII · TE9 · cassette de sélection, 314–2 638
- UbiZm–(vide)–Tnos · cassette d’expression vide, 2 702–4 523
- MCS · 8 sites uniques · en 4 210, 4 299
- SfiI ×2 · encadre la cassette UbiZm–(empty)–Tnos · en 2 679, 4 575
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of 594pUbi-BA* into B483p6o2x35s-LH*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P2x35s | Promoteur misc_feature | 314 | 1 098 | 785 | + |
| hptII | Marqueur de sélection CDS | 1 116 | 1 685 | 570 | + |
| int | Site misc_feature | 1 686 | 1 874 | 189 | + |
| hptII | Marqueur de sélection CDS | 1 875 | 2 330 | 456 | + |
| TE9 | Terminateur misc_feature | 2 348 | 2 638 | 291 | + |
| UbiZm | Promoteur misc_feature | 2 702 | 4 209 | 1 508 | + |
| int | Site misc_feature | 3 688 | 4 207 | 520 | + |
| Tnos | Terminateur misc_feature | 4 270 | 4 523 | 254 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 4 646 | 4 669 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 5 204 | 5 901 | 698 | + |
| pVS1 | Origine / squelette misc_feature | 6 450 | 10 155 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 10 339 | 11 349 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p6o2x35s-UbiZm-LH (B514; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6o2x35s-UbiZm-LH)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.