p6oAct-UbiZm-oGusi-LH C629
Vecteur binaire avec Act–hptII et UbiZm–oGus, pour les monocotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| EcoRIG^AATTC | 691 | dans pAct |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 1 212 | dans pAct |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 3 270 | entre E9 et Ubi |
| SpeIA^CTAGT | 3 309 | entre E9 et Ubi |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 3 323 | entre E9 et Ubi |
| HindIIIA^AGCTT | 4 841 | entre Ubi et ogus |
| MluIA^CGCGT | 4 847 | entre Ubi et ogus |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 5 763 | dans ogus |
| SalIG^TCGAC | 6 865 | entre ogus et OCS |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 7 075 | entre OCS et RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 7 102 | entre OCS et RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 7 134 | entre OCS et RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 7 525 | entre RB et ColE1 |
| BbsI (BpiI)GAAGAC(2/6) | 8 935 | entre ColE1 et pVS1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 11 739 | dans pVS1 |
Double coupure : BamHI (1 408, 3 315), PstI (3 270, 4 835), SphI (3 276, 7 259), XhoI (1 720, 4 029), NcoI (3 296, 4 376), ClaI (4 562, 11 935), EcoRV (5 841, 7 646), ApaI (4 389, 7 096), SfiI (3 301, 7 079), AgeI (12 349, 12 657), NsiI (561, 4 607), SacII (2 108, 2 938), XmnI (2 620, 6 500), SapI (8 578, 12 475), AarI (1 002, 5 655).
Aucun site : AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, BsrGI, PvuII.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- Act
- Gène 1
- hptII
- Promoteur 2
- UbiZm
- Gène 2
- oGus
- Caractéristiques
- monocotylédones
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 14 373 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 04-OCT-2017
Construction
- pAct–hptII · E9 · cassette de sélection, 313–3 260
- Ubi–ogus · OCS · cassette avec insert, 3 331–7 065
- SfiI ×2 · encadre la cassette Ubi–ogus · en 3 301, 7 079
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of B497pUbiZm-MoGusi-ocs* into B488p6oAct-LH* sequence corrected (colE1)
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| pAct | Promoteur misc_feature | 313 | 1 710 | 1 398 | + |
| hptII | Marqueur de sélection CDS | 1 738 | 2 307 | 570 | + |
| int | Site misc_feature | 2 308 | 2 496 | 189 | + |
| hptII | Marqueur de sélection CDS | 2 497 | 2 952 | 456 | + |
| E9 | Terminateur misc_feature | 2 970 | 3 260 | 291 | + |
| Ubi | Promoteur misc_feature | 3 331 | 4 838 | 1 508 | + |
| Int | Site misc_feature | 4 317 | 4 836 | 520 | + |
| ogus | Séquence codante CDS | 4 864 | 5 478 | 615 | + |
| sans nom | Site misc_feature | 4 960 | 4 963 | 4 | + |
| sans nom | Site misc_feature | 5 171 | 5 174 | 4 | + |
| sans nom | Site misc_feature | 5 477 | 5 480 | 4 | + |
| 'Intron | Site misc_feature | 5 479 | 5 667 | 189 | + |
| ogus | Séquence codante CDS | 5 668 | 6 864 | 1 197 | + |
| sans nom | Site misc_feature | 5 717 | 5 720 | 4 | + |
| sans nom | Site misc_feature | 5 756 | 5 759 | 4 | + |
| sans nom | Site misc_feature | 5 866 | 5 869 | 4 | + |
| sans nom | Site misc_feature | 6 477 | 6 479 | 3 | + |
| sans nom | Site misc_feature | 6 500 | 6 503 | 4 | + |
| OCS | Terminateur misc_feature | 6 870 | 7 065 | 196 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 7 150 | 7 173 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 7 708 | 8 405 | 698 | + |
| pVS1 | Origine / squelette misc_feature | 8 954 | 12 659 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 12 843 | 13 853 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p6oAct-UbiZm-oGusi-LH (C629; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6oAct-UbiZm-oGusi-LH)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.