p6oN-LH B399
Vecteur binaire avec Nos–hptII, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 303 | entre BL et Pnos |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 607 | entre Pnos et hptII |
| MluIA^CGCGT | 1 840 | entre hptII et TE9 |
| PstICTGCA^G | 2 150 | entre TE9 et BR |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2 150 | entre TE9 et BR |
| NcoIC^CATGG | 2 176 | entre TE9 et BR |
| SpeIA^CTAGT | 2 189 | entre TE9 et BR |
| BamHIG^GATCC | 2 195 | entre TE9 et BR |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 2 203 | entre TE9 et BR |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 2 211 | entre TE9 et BR |
| EcoRIG^AATTC | 2 213 | entre TE9 et BR |
| HindIIIA^AGCTT | 2 219 | entre TE9 et BR |
| SalIG^TCGAC | 2 231 | entre TE9 et BR |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2 241 | entre TE9 et BR |
| BglIIA^GATCT | 2 251 | entre TE9 et BR |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 2 262 | entre TE9 et BR |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2 268 | entre TE9 et BR |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 2 300 | entre TE9 et BR |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 2 691 | entre BR et ColE1 |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 2 812 | entre BR et ColE1 |
| BbsI (BpiI)GAAGAC(2/6) | 4 101 | entre ColE1 et pVS1 ORI |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 6 905 | dans pVS1 ORI |
Double coupure : SphI (2 156, 2 425), NdeI (3 806, 5 565), NheI (503, 7 021), ClaI (2 226, 7 101), SfiI (2 181, 2 245), FseI (4 572, 6 677), MfeI (14, 1 301), AgeI (7 515, 7 823), StuI (1 521, 2 239), XmnI (1 507, 1 842), BstEII (915, 8 386), BsmBI (3 984, 5 037), SapI (3 744, 7 641).
Aucun site : SacI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, BsrGI, PvuII, AarI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- Nos
- Gène 1
- hptII
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 9 539 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 27-JAN-2016
Construction
- Pnos–hptII · TE9 · cassette de sélection, 309–2 140
- MCS · 15 sites uniques · en 2 150, 2 300
- SfiI ×2 · encadre le MCS · en 2 181, 2 245
Ligation of hpt-Xho-Mlu* into 715p7N-TE9*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| BL | Site misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| Pnos | Promoteur misc_feature | 309 | 606 | 298 | + |
| hptII | Marqueur de sélection CDS | 625 | 1 194 | 570 | + |
| int | Site misc_feature | 1 195 | 1 383 | 189 | + |
| hptII | Marqueur de sélection CDS | 1 384 | 1 839 | 456 | + |
| TE9 | Terminateur misc_feature | 1 850 | 2 140 | 291 | + |
| BR | Site misc_feature | 2 316 | 2 339 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 2 874 | 3 571 | 698 | + |
| pVS1 ORI | Origine / squelette misc_feature | 4 120 | 7 825 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 8 009 | 9 019 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p6oN-LH (B399; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6oN-LH; RRID:SCR_029231)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.