p7D35s-UbiAt-GusiX F972
Vecteur binaire avec 35s–bar et Ubq10–oGus, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 587 | entre 35S et Bar'' |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1 656 | entre E9 et Pro-Ubq10At |
| NotIGC^GGCCGC | 1 665 | entre E9 et Pro-Ubq10At |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 2 765 | dans Pro-Ubq10At |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 2 770 | dans Pro-Ubq10At |
| SpeIA^CTAGT | 3 148 | entre Pro-Ubq10At et GusX' |
| BamHIG^GATCC | 3 154 | entre Pro-Ubq10At et GusX' |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 3 162 | entre Pro-Ubq10At et GusX' |
| HindIIIA^AGCTT | 3 178 | entre Pro-Ubq10At et GusX' |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 3 497 | dans GusX' |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 3 541 | dans GusX' |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 5 222 | dans OCS |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 5 412 | entre OCS et Right Border Region |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 5 442 | entre OCS et Right Border Region |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 5 474 | dans Right Border Region |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 5 599 | dans Right Border Region |
Double coupure : EcoRI (2 332, 3 172), SalI (2 510, 5 202), PstI (1 656, 3 170), BglII (3 077, 5 422), MluI (1 346, 3 184), SfiI (1 664, 5 416), StuI (1 658, 5 410), SacII (1 228, 1 245), BstEII (3 470, 9 277), AarI (1 128, 3 992).
Aucun site : NcoI, NdeI, NheI, ClaI, AscI, PacI, FseI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, NsiI, BsrGI, PvuII.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- 35s
- Gène 1
- bar
- Promoteur 2
- Ubq10
- Gène 2
- oGus
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- Bar'', 'Bar', strep/spec
- Taille
- 10 127 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 17-JAN-2024
Construction
- 35S–Bar · E9 · cassette de sélection, 169–1 646
- Pro-Ubq10At–GusX · OCS · cassette avec insert, 1 672–5 402
- MCS · 4 sites uniques · en 3 148, 3 178
- SfiI ×2 · encadre la cassette Pro-Ubq10At–GusX · en 1 664, 5 416
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of F475p6D35s-GusiX* into E150p7D35s-UbiAt*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB' | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| 35S | Promoteur misc_feature | 169 | 584 | 416 | + |
| Bar'' | Marqueur de sélection CDS | 605 | 838 | 234 | + |
| STLS1 | Autre misc_feature | 839 | 1 027 | 189 | + |
| ''Bar' | Marqueur de sélection CDS | 1 028 | 1 343 | 316 | + |
| 'E9 | Terminateur misc_feature | 1 356 | 1 646 | 291 | + |
| Pro-Ubq10At | Promoteur misc_feature | 1 672 | 3 147 | 1 476 | + |
| TATA | Site misc_feature | 2 743 | 2 746 | 4 | + |
| Ubi cds 5` | Séquence codante CDS | 2 776 | 2 839 | 64 | + |
| íntron | Autre misc_feature | 2 842 | 3 145 | 304 | + |
| TATA | Site CDS | 2 907 | 2 910 | 4 | + |
| GusX' | Séquence codante CDS | 3 201 | 3 815 | 615 | + |
| ''Intron | Site misc_feature | 3 816 | 4 004 | 189 | + |
| ''GusX | Séquence codante CDS | 4 005 | 5 201 | 1 197 | + |
| OCS | Terminateur misc_feature | 5 207 | 5 402 | 196 | + |
| Right Border Region | Autre misc_feature | 5 445 | 6 047 | 603 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 5 490 | 5 513 | 24 | + |
| 'ColE1'' | Origine / squelette misc_feature | 6 061 | 6 719 | 659 | + |
| ''pVS1 ORI''' | Origine / squelette misc_feature | 6 748 | 8 711 | 1 964 | + |
| ParB | Séquence codante CDS | 7 074 | 8 249 | 1 176 | + |
| strep/spec | Marqueur de sélection CDS | 8 900 | 9 910 | 1 011 | + |
| Left Border Region | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 9 978 | 163 | 0 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p7D35s-UbiAt-GusiX (F972; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p7D35s-UbiAt-GusiX)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.