p7D35s-UbiAt-mEGFP E039
Vecteur binaire avec 35s–bar et Ubq10–mEGFP, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 587 | entre P35S et Bar |
| AarICACCTGC(4/8) | 1 128 | dans Bar |
| PstICTGCA^G | 1 656 | entre TE9 et Pro-Ubq10At |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1 656 | entre TE9 et Pro-Ubq10At |
| NotIGC^GGCCGC | 1 665 | entre TE9 et Pro-Ubq10At |
| SpeIA^CTAGT | 1 672 | entre TE9 et Pro-Ubq10At |
| BamHIG^GATCC | 1 678 | entre TE9 et Pro-Ubq10At |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1 686 | entre TE9 et Pro-Ubq10At |
| EcoRIG^AATTC | 2 350 | dans Pro-Ubq10At |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 2 783 | dans Pro-Ubq10At |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 2 788 | dans Pro-Ubq10At |
| HindIIIA^AGCTT | 3 168 | entre Pro-Ubq10At et mEGFP |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 3 531 | dans mEGFP |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 3 762 | dans mEGFP |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 4 121 | dans OCS |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 4 375 | dans Right Border Region |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 4 500 | dans Right Border Region |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 4 766 | dans Right Border Region |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 8 178 | dans strep/spec |
Double coupure : SalI (2 528, 4 101), KpnI (3 412, 4 343), BglII (3 095, 4 321), MluI (1 346, 3 174), SfiI (1 664, 4 315), StuI (1 658, 4 309), EagI (1 665, 4 757), SacII (1 228, 1 245).
Aucun site : NcoI, NdeI, NheI, AscI, PacI, FseI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, HpaI, NsiI, AflII, BsrGI, PvuII, BsaI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- 35s
- Gène 1
- bar
- Promoteur 2
- Ubq10
- Gène 2
- mEGFP
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- strep/spec
- Taille
- 9 028 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 26-AUG-2020
Construction
- P35S–Bar · TE9 · cassette de sélection, 169–1 646
- Pro-Ubq10At–mEGFP · OCS · cassette avec insert, 1 690–4 301
- MCS · 6 sites uniques · en 1 656, 1 686
- SfiI ×2 · encadre la cassette Pro-Ubq10At–mEGFP · en 1 664, 4 315
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of E038pUbiAt-mEGFP* into D011p7D35s*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB' | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P35S | Promoteur misc_feature | 169 | 584 | 416 | + |
| Bar | Marqueur de sélection CDS | 605 | 838 | 234 | + |
| STLS1 | Autre misc_feature | 839 | 1 027 | 189 | + |
| Bar | Marqueur de sélection CDS | 1 028 | 1 343 | 316 | + |
| TE9 | Terminateur misc_feature | 1 356 | 1 646 | 291 | + |
| Pro-Ubq10At | Promoteur misc_feature | 1 690 | 3 165 | 1 476 | + |
| TATA | Site misc_feature | 2 761 | 2 764 | 4 | + |
| Ubi cds 5 | Promoteur misc_feature | 2 794 | 2 859 | 66 | + |
| íntron | Autre misc_feature | 2 860 | 3 163 | 304 | + |
| mEGFP | Séquence codante CDS | 3 191 | 3 569 | 379 | + |
| ST-LS1 | Séquence codante CDS | 3 570 | 3 758 | 189 | + |
| mEGFP | Séquence codante CDS | 3 759 | 4 096 | 338 | + |
| A206K - monomeric protein | Site misc_feature | 3 995 | 3 997 | 3 | + |
| OCS | Terminateur misc_feature | 4 106 | 4 301 | 196 | + |
| Right Border Region | Autre misc_feature | 4 346 | 4 948 | 603 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 4 391 | 4 414 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 4 962 | 5 620 | 659 | + |
| ''pVS1 ORI''' | Origine / squelette misc_feature | 5 649 | 7 612 | 1 964 | + |
| ParB | Séquence codante CDS | 5 975 | 7 150 | 1 176 | + |
| strep/spec | Marqueur de sélection CDS | 7 801 | 8 811 | 1 011 | + |
| Left Border Region | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 8 879 | 163 | 0 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p7D35s-UbiAt-mEGFP (E039; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p7D35s-UbiAt-mEGFP)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.