p7o-LH-U10-Gusi D266
Vecteur binaire avec 35s–bar et Ubq10–oGus, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 727 | entre P35S et Bar |
| PstICTGCA^G | 1 796 | entre TE9 et Pro-Ubq10At |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1 796 | entre TE9 et Pro-Ubq10At |
| NcoIC^CATGG | 1 822 | entre TE9 et Pro-Ubq10At |
| SpeIA^CTAGT | 1 835 | entre TE9 et Pro-Ubq10At |
| BamHIG^GATCC | 1 841 | entre TE9 et Pro-Ubq10At |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1 849 | entre TE9 et Pro-Ubq10At |
| EcoRIG^AATTC | 2 513 | dans Pro-Ubq10At |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 2 946 | dans Pro-Ubq10At |
| HindIIIA^AGCTT | 3 331 | entre Pro-Ubq10At et ogus |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 4 253 | dans ogus |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 5 565 | entre OCS et RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 5 592 | entre OCS et RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 5 624 | entre OCS et RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 6 015 | entre RB et ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 10 229 | dans pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 10 345 | dans pVS1 |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 10 425 | dans pVS1 |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 11 710 | dans Sm/Sp |
Double coupure : SalI (2 691, 5 355), SphI (1 802, 5 749), NdeI (7 130, 8 889), MluI (1 486, 3 337), SfiI (1 827, 5 569), FseI (7 896, 10 001), AgeI (10 839, 11 147), StuI (4 859, 5 563), SacII (1 368, 1 385), AarI (1 268, 4 145).
Aucun site : AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, NsiI, BsrGI, PvuII.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- 35s
- Gène 1
- bar
- Promoteur 2
- Ubq10
- Gène 2
- oGus
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 12 863 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 26-AUG-2020
Construction
- P35S–Bar · TE9 · cassette de sélection, 309–1 786
- Pro-Ubq10At–ogus · OCS · cassette avec insert, 1 853–5 555
- MCS · 6 sites uniques · en 1 796, 1 849
- SfiI ×2 · encadre la cassette Pro-Ubq10At–ogus · en 1 827, 5 569
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of B494pUbiAt-DoGusi-ocs* into B414p7o-LH*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P35S | Promoteur misc_feature | 309 | 724 | 416 | + |
| Bar | Marqueur de sélection CDS | 745 | 978 | 234 | + |
| STLS1 | Autre misc_feature | 979 | 1 167 | 189 | + |
| Bar | Marqueur de sélection CDS | 1 168 | 1 483 | 316 | + |
| TE9 | Terminateur misc_feature | 1 496 | 1 786 | 291 | + |
| Pro-Ubq10At | Promoteur misc_feature | 1 853 | 3 328 | 1 476 | + |
| TATA | Site misc_feature | 2 924 | 2 927 | 4 | + |
| Ubi cds 5 | Promoteur misc_feature | 2 957 | 3 020 | 64 | + |
| íntron | Autre misc_feature | 3 023 | 3 326 | 304 | + |
| ogus | Séquence codante CDS | 3 354 | 3 968 | 615 | + |
| 'Intron | Site misc_feature | 3 969 | 4 157 | 189 | + |
| ogus | Séquence codante CDS | 4 158 | 5 354 | 1 197 | + |
| OCS | Terminateur misc_feature | 5 360 | 5 555 | 196 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 5 640 | 5 663 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 6 198 | 6 895 | 698 | + |
| bom | Origine / squelette misc_feature | 6 932 | 7 191 | 260 | + |
| pVS1 | Origine / squelette misc_feature | 7 444 | 11 149 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 11 333 | 12 343 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p7o-LH-U10-Gusi (D266; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p7o-LH-U10-Gusi; RRID:SCR_029231)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.