p7o2x35s-ActOs-LGFP C683
Vecteur binaire avec 35s–bar et Act–EGFP, pour les monocotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 303 | entre LB et P35S |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 1 098 | entre P35S et Bar |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2 176 | entre TE9 et PAct |
| NcoIC^CATGG | 2 202 | entre TE9 et PAct |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 2 466 | dans PAct |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 3 117 | dans mRNA |
| SpeIA^CTAGT | 3 615 | entre PAct et link |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 3 630 | entre PAct et link |
| HindIIIA^AGCTT | 3 646 | entre PAct et link |
| MluIA^CGCGT | 3 652 | entre PAct et link |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 3 658 | entre PAct et link |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 4 055 | dans EGFP |
| SalIG^TCGAC | 4 625 | entre EGFP et OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 4 833 | entre OCS et RB |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 4 835 | entre OCS et RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 4 862 | entre OCS et RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 4 894 | entre OCS et RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 5 285 | entre RB et ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 9 499 | dans pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 9 615 | dans pVS1 |
Double coupure : EcoRI (2 596, 3 640), BamHI (3 313, 3 622), PstI (2 176, 3 638), SphI (2 182, 5 019), ClaI (4 286, 9 695), EcoRV (966, 5 406), SfiI (2 207, 4 839), AgeI (10 109, 10 417), SacII (1 739, 1 756), XmnI (601, 926), BstEII (3 150, 10 980), SapI (6 338, 10 235), AarI (1 639, 2 907).
Aucun site : AscI, PacI, SwaI, AvrII, HpaI, PvuII.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- 35s
- Gène 1
- bar
- Promoteur 2
- Act
- Gène 2
- EGFP
- Caractéristiques
- monocotylédones
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 12 133 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 26-AUG-2020
Construction
- P35S–Bar · TE9 · cassette de sélection, 314–2 166
- PAct–EGFP · OCS · cassette avec insert, 2 218–4 825
- MCS · 5 sites uniques · en 3 615, 3 658
- SfiI ×2 · encadre la cassette PAct–EGFP · en 2 207, 4 839
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of B635pActOs-LGFP* into B484p7o2x35s-LH*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P35S | Promoteur misc_feature | 314 | 1 098 | 785 | + |
| Bar | Marqueur de sélection CDS | 1 116 | 1 349 | 234 | + |
| STLS1 | Autre misc_feature | 1 350 | 1 538 | 189 | + |
| Bar | Marqueur de sélection CDS | 1 539 | 1 856 | 318 | + |
| TE9 | Terminateur misc_feature | 1 876 | 2 166 | 291 | + |
| PAct | Promoteur misc_feature | 2 218 | 3 615 | 1 398 | + |
| mRNA | Autre misc_feature | 3 061 | 3 615 | 555 | + |
| intron | Site misc_feature | 3 151 | 3 612 | 462 | + |
| link | Site misc_feature | 3 664 | 3 714 | 51 | + |
| EGFP | Séquence codante CDS | 3 715 | 4 093 | 379 | + |
| mut ok | Site misc_feature | 3 933 | 3 933 | 1 | + |
| ST-LS1 | Séquence codante CDS | 4 094 | 4 282 | 189 | + |
| EGFP | Séquence codante CDS | 4 283 | 4 620 | 338 | + |
| OCS | Terminateur misc_feature | 4 630 | 4 825 | 196 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 4 910 | 4 933 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 5 468 | 6 165 | 698 | + |
| pVS1 | Origine / squelette misc_feature | 6 714 | 10 419 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 10 603 | 11 613 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p7o2x35s-ActOs-LGFP (C683; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p7o2x35s-ActOs-LGFP)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.