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DNA Cloning Service
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Binaires

p7oM-LH B474

Vecteur binaire avec 35s–bar, pour les monocotylédones.

123456789pVS1Sm/SpColE1P35SbarTE9barintLBRBXbaI (303)XmnI, XhoIAarI (1268)PstI, SbfI, NcoI, SpeIBamHI, SmaI, NsiI, EcoRIHindIII, SalI, StuI, AflIIBglII, KpnI, PmeIAatII (2346)BsiWI, NheIBstEII (8041)B474p7oM-LH9 194 bp

GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq

S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.

Sites de restriction

Enzyme à coupure unique · siteCoupe enEmplacement
XbaIT^CTAGA303entre LB et P35S
XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC594dans P35S
XhoI (PaeR7I)C^TCGAG727entre P35S et bar
AarICACCTGC(4/8)1 268dans bar
PstICTGCA^G1 805entre TE9 et RB
SbfI (SdaI)CCTGCA^GG1 805entre TE9 et RB
NcoIC^CATGG1 831entre TE9 et RB
SpeIA^CTAGT1 844entre TE9 et RB
BamHIG^GATCC1 850entre TE9 et RB
SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG1 858entre TE9 et RB
NsiI (Mph1103I)ATGCA^T1 866entre TE9 et RB
EcoRIG^AATTC1 868entre TE9 et RB
HindIIIA^AGCTT1 874entre TE9 et RB
SalIG^TCGAC1 886entre TE9 et RB
StuI (Eco147I)AGG^CCT1 894entre TE9 et RB
AflII (BspTI)C^TTAAG1 896entre TE9 et RB
BglIIA^GATCT1 906entre TE9 et RB
KpnI (Acc65I)GGTAC^C1 923entre TE9 et RB
PmeI (MssI)GTTT^AAAC1 955entre TE9 et RB
AatII (ZraI)GACGT^C2 346entre RB et ColE1
BsiWI (Pfl23II)C^GTACG6 560dans pVS1
NheI (BmtI)G^CTAGC6 676dans pVS1
BstEII (Eco91I)G^GTNACC8 041dans Sm/Sp

Double coupure : SphI (1 811, 2 080), NdeI (3 461, 5 220), ClaI (1 881, 6 756), EcoRV (634, 2 467), SfiI (1 836, 1 900), FseI (4 227, 6 332), MfeI (14, 1 085), AgeI (7 170, 7 478), SacII (1 368, 1 385), BsmBI (3 639, 4 692), SapI (3 399, 7 296).

Aucun site : SacI, MluI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, BsrGI, PvuII.

Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.

Promoteur 1
35s
Gène 1
bar
Caractéristiques
monocotylédones
Autres marqueurs
Sm/Sp
Taille
9 194 bp, circulaire
Date de l’enregistrement
22-JAN-2016

Construction

  • P35S–bar · TE9 · cassette de sélection, 309–1 795
  • MCS · 15 sites uniques · en 1 805, 1 955
  • SfiI ×2 · encadre le MCS · en 1 836, 1 900
  • Bordures de l’ADN-T · LB, RB

B474p7oM-LH rotated to position 8947

Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.

Éléments annotés

ÉlémentTypeDébutFinLongueurBrin
LBBordure de l’ADN-T misc_feature12424+
P35SPromoteur misc_feature309724416+
barMarqueur de sélection CDS745978234+
intSite misc_feature9791 167189+
barMarqueur de sélection CDS1 1681 485318+
TE9Terminateur misc_feature1 5051 795291+
RBBordure de l’ADN-T misc_feature1 9711 99424+
ColE1Origine / squelette misc_feature2 5293 226698+
pVS1Origine / squelette misc_feature3 7757 4803 706+
Sm/SpMarqueur de sélection CDS7 6648 6741 011+

PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite

Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.

Comment citer

Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.

p7oM-LH (B474; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p7oM-LH)

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