Binaires · Cassettes multiples
p7oR3-ActO-ActO-UbiZ-UbiZ F510
Vecteur binaire avec Act–bar.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2 174 | entre E9 et pAct |
| SpeIA^CTAGT | 3 574 | entre pAct et NOS-T' |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 3 589 | entre pAct et NOS-T' |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3 633 | dans NOS-T' |
| HindIIIA^AGCTT | 5 285 | entre pAct et OCS |
| SalIG^TCGAC | 5 297 | entre pAct et OCS |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 5 500 | entre OCS et Ubi-int |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 5 523 | entre OCS et Ubi-int |
| AscI (SgsI)GG^CGCGCC | 7 063 | entre Ubi-int et Thsp17 |
| AvrII (XmaJI)C^CTAGG | 8 818 | entre Ubi-int et T35S |
| MluIA^CGCGT | 8 830 | entre Ubi-int et T35S |
| PacITTAAT^TAA | 9 059 | entre T35S et RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 9 093 | entre T35S et RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 9 125 | entre T35S et RB |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 9 250 | entre RB et ColE1 |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 9 516 | entre RB et ColE1 |
Double coupure : EcoRI (2 555, 4 252), SacI (3 076, 4 773), EcoRV (966, 9 637), SfiI (5 513, 9 070), AgeI (13 161, 13 469), SacII (1 739, 1 756), XmnI (601, 926), SapI (10 569, 13 287).
Aucun site : BstBI, HpaI, StuI, PvuII.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- Act
- Gène 1
- bar
- Promoteur 2
- UbiZm
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 15 185 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 08-JUN-2023
Construction
- P2x35s–Bar · E9 · cassette de sélection, 314–2 164
- pAct–(vide)–NOS-T · cassette d’expression vide, 2 177–3 852
- pAct–(vide)–OCS · cassette d’expression vide, 3 874–5 497
- Ubi-int–(vide)–Thsp17 · cassette d’expression vide, 5 536–7 277
- Ubi-int–(vide)–T35S · cassette d’expression vide, 7 307–9 041
- SfiI ×2 · encadre 2 cassettes · en 5 513, 9 070
- AscI/PacI · un site chacun · en 7 063, 9 059
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of F516pBA-2xActOs* into F508p7o2x35soR3-UbiZ-UbiZ*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P2x35s' | Promoteur misc_feature | 314 | 1 098 | 785 | + |
| Bar | Marqueur de sélection CDS | 1 116 | 1 349 | 234 | + |
| STLS1 | Autre misc_feature | 1 350 | 1 538 | 189 | + |
| Bar | Marqueur de sélection CDS | 1 539 | 1 856 | 318 | + |
| 'E9 | Terminateur misc_feature | 1 874 | 2 164 | 291 | + |
| pAct | Promoteur misc_feature | 2 177 | 3 574 | 1 398 | + |
| AT reich | Site CDS | 2 834 | 2 872 | 39 | + |
| mRNA | Séquence codante CDS | 3 020 | 3 574 | 555 | + |
| intron | Site CDS | 3 110 | 3 571 | 462 | + |
| NOS-T' | Terminateur misc_feature | 3 604 | 3 852 | 249 | + |
| pAct | Promoteur misc_feature | 3 874 | 5 271 | 1 398 | + |
| AT reich | Site CDS | 4 531 | 4 569 | 39 | + |
| mRNA | Séquence codante CDS | 4 717 | 5 271 | 555 | + |
| intron | Site CDS | 4 807 | 5 268 | 462 | + |
| OCS | Terminateur misc_feature | 5 302 | 5 497 | 196 | + |
| 'Ubi-int | Promoteur misc_feature | 5 536 | 7 043 | 1 508 | + |
| Intron | Site misc_feature | 6 522 | 7 041 | 520 | + |
| 'Thsp17 | Autre misc_feature | 7 071 | 7 277 | 207 | + |
| 'Ubi-int | Promoteur misc_feature | 7 307 | 8 814 | 1 508 | + |
| Intron | Site misc_feature | 8 293 | 8 812 | 520 | + |
| T35S | Terminateur misc_feature | 8 840 | 9 041 | 202 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 9 141 | 9 164 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 9 699 | 10 396 | 698 | + |
| 'pVS1 | Origine / squelette misc_feature | 10 684 | 13 471 | 2 788 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 13 655 | 14 665 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p7oR3-ActO-ActO-UbiZ-UbiZ (F510; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p7oR3-ActO-ActO-UbiZ-UbiZ)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.