p7oU10-oGFPint B437
Vecteur binaire avec Ubq10–bar et link-EGFP, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 1 402 | dans UBQ10 |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 1 786 | entre UBQ10 et bar |
| AarICACCTGC(4/8) | 2 327 | dans bar |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2 855 | entre TE9 et gfp |
| NcoIC^CATGG | 2 881 | entre TE9 et gfp |
| SpeIA^CTAGT | 2 894 | entre TE9 et gfp |
| BamHIG^GATCC | 2 900 | entre TE9 et gfp |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 2 908 | entre TE9 et gfp |
| HindIIIA^AGCTT | 2 924 | entre TE9 et gfp |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 3 287 | dans gfp |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 4 064 | entre Tocs et RB |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 4 066 | entre Tocs et RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 4 125 | entre Tocs et RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 4 516 | entre RB et ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 8 730 | dans pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 8 846 | dans pVS1 |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 10 211 | dans Sm/Sp |
Double coupure : EcoRI (969, 2 918), SalI (1 147, 3 856), PstI (2 855, 2 916), SphI (2 861, 4 250), KpnI (3 168, 4 093), NdeI (5 631, 7 390), BglII (1 714, 4 076), ClaI (3 518, 8 926), MluI (2 545, 2 930), SfiI (2 886, 4 070), FseI (6 397, 8 502), AgeI (9 340, 9 648), SacII (2 427, 2 444), XmnI (570, 2 547), BbsI (1 589, 5 926).
Aucun site : AscI, PacI, SwaI, AvrII, HpaI, NsiI, BsrGI, PvuII.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- Ubq10
- Gène 1
- bar
- Gène 2
- link-EGFP
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 11 364 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 22-JAN-2016
Construction
- UBQ10–bar · TE9 · cassette de sélection, 309–2 845
- MCS · 6 sites uniques · en 2 855, 2 924
- SfiI ×2 · encadre le MCS · en 2 886, 4 070
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of B444pmGFPD-ocs* into B434p7oU10-LH*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| UBQ10 | Autre misc_feature | 309 | 1 784 | 1 476 | + |
| Ubi cds 5 | Promoteur misc_feature | 1 413 | 1 476 | 64 | + |
| int | Site misc_feature | 1 479 | 1 782 | 304 | + |
| bar | Marqueur de sélection CDS | 1 804 | 2 037 | 234 | + |
| int | Site misc_feature | 2 038 | 2 226 | 189 | + |
| bar | Marqueur de sélection CDS | 2 227 | 2 542 | 316 | + |
| TE9 | Terminateur misc_feature | 2 555 | 2 845 | 291 | + |
| gfp | Séquence codante CDS | 2 947 | 3 325 | 379 | + |
| int | Site CDS | 3 326 | 3 514 | 189 | + |
| gfp | Séquence codante CDS | 3 515 | 3 852 | 338 | + |
| Tocs | Terminateur misc_feature | 3 861 | 4 056 | 196 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 4 141 | 4 164 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 4 699 | 5 396 | 698 | + |
| bom | Origine / squelette misc_feature | 5 433 | 5 692 | 260 | + |
| pVS1 | Origine / squelette misc_feature | 5 945 | 9 650 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 9 834 | 10 844 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p7oU10-oGFPint (B437; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p7oU10-oGFPint)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.