p7or-gus C682
Vecteur binaire avec bar et oGus.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 1 736 | dans bar' |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2 168 | entre E9 et Tnos |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 2 481 | entre Tnos et GUS |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 3 252 | dans GUS |
| SpeIA^CTAGT | 4 561 | entre GUS et Ubi-int |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 6 085 | entre Ubi-int et RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 6 146 | entre Ubi-int et RB |
| FseIGGCCGG^CC | 9 344 | dans pVS1' |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 9 572 | dans pVS1' |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 11 053 | dans Sm/Sp' |
Double coupure : KpnI (1 818, 6 114), XhoI (1 099, 5 371), NheI (4 951, 9 688), ClaI (4 840, 9 768), SfiI (2 199, 6 091), AgeI (10 182, 10 490), NsiI (2 349, 4 801), AflII (2 432, 6 087), BsrGI (2 797, 3 223), PvuII (1 796, 3 966), AatII (4 553, 6 537), XmnI (602, 927), BsaI (10 091, 10 511), SapI (7 590, 10 308).
Aucun site : EcoRI, BamHI, HindIII, SalI, SmaI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, HpaI, BsmBI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Gène 1
- bar
- Gène 2
- oGus
- Autres marqueurs
- bar', Sm/Sp'
- Taille
- 12 206 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 27-OCT-2017
Construction
- P2x35s–bar · E9 · cassette de sélection, 315–2 158
- Ubi-int–GUS · Tnos · cassette avec insert, 2 213–6 075 (brin −)
- SfiI ×2 · encadre la cassette Ubi-int–GUS · en 2 199, 6 091
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of p7i-UG* into B819p7ioR-UZmCwtoi*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P2x35s' | Promoteur misc_feature | 315 | 1 099 | 785 | + |
| bar | Marqueur de sélection CDS | 1 113 | 1 346 | 234 | + |
| STLS1 | Autre misc_feature | 1 347 | 1 535 | 189 | + |
| bar' | Marqueur de sélection CDS | 1 536 | 1 853 | 318 | + |
| E9 | Terminateur misc_feature | 1 868 | 2 158 | 291 | + |
| Tnos | Terminateur misc_feature | 2 213 | 2 476 | 264 | − |
| GUS | Séquence codante CDS | 2 537 | 3 966 | 1 430 | − |
| Intron | Site CDS | 3 967 | 4 155 | 189 | − |
| GUS | Séquence codante CDS | 4 156 | 4 540 | 385 | − |
| Ubi-int | Promoteur misc_feature | 4 567 | 6 075 | 1 509 | − |
| Intron | Site misc_feature | 4 569 | 5 088 | 520 | − |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 6 162 | 6 185 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 6 720 | 7 417 | 698 | + |
| 'pVS1' | Origine / squelette misc_feature | 7 705 | 10 492 | 2 788 | + |
| Sm/Sp' | Marqueur de sélection CDS | 10 676 | 11 686 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p7or-gus (C682; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p7or-gus; RRID:SCR_029231)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.