p9D35s-UbiAt F566
Vecteur binaire avec 35s–nptII, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 587 | entre 35S et NptIIo |
| FseIGGCCGG^CC | 1 254 | dans NptIIo |
| MluIA^CGCGT | 1 598 | entre NptIIo et E9 |
| PstICTGCA^G | 1 908 | entre E9 et Pro-Ubq10At |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1 908 | entre E9 et Pro-Ubq10At |
| NotIGC^GGCCGC | 1 917 | entre E9 et Pro-Ubq10At |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 3 022 | dans Pro-Ubq10At |
| SpeIA^CTAGT | 3 400 | entre Pro-Ubq10At et OCS |
| BamHIG^GATCC | 3 409 | entre Pro-Ubq10At et OCS |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 3 420 | entre Pro-Ubq10At et OCS |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 3 427 | entre Pro-Ubq10At et OCS |
| HindIIIA^AGCTT | 3 445 | entre Pro-Ubq10At et OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 3 466 | dans OCS |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3 689 | entre OCS et Right Border Region |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 3 721 | dans Right Border Region |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 3 846 | dans Right Border Region |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 4 112 | dans Right Border Region |
Double coupure : EcoRI (2 584, 3 436), SalI (2 762, 3 647), SacI (1 115, 3 017), BglII (3 329, 3 667), ApaI (688, 3 680), SfiI (1 916, 3 661), MfeI (14, 1 008), StuI (1 910, 3 655), EagI (1 917, 4 103), BstEII (1 357, 7 524), AarI (1 078, 1 199).
Aucun site : NcoI, NdeI, NheI, ClaI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, HpaI, NsiI, AflII, SacII, PvuII, BsaI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- 35s
- Gène 1
- nptII
- Promoteur 2
- Ubq10
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- NptIIo, strep/spec
- Taille
- 8 374 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 14-APR-2023
Construction
- 35S–NptIIo · E9 · cassette de sélection, 169–1 898
- Pro-Ubq10At–(vide)–OCS · cassette d’expression vide, 1 924–3 646
- MCS · 6 sites uniques · en 3 400, 3 466
- SfiI ×2 · encadre la cassette Pro-Ubq10At–(empty)–OCS · en 1 916, 3 661
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of U10-ocs-Not-Bsa* into D012p9D35s*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB' | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| 35S | Promoteur misc_feature | 169 | 584 | 416 | + |
| NptIIo | Marqueur de sélection CDS | 605 | 903 | 299 | + |
| 'intron | Séquence codante CDS | 904 | 1 090 | 187 | + |
| NptIIo | Marqueur de sélection CDS | 1 091 | 1 594 | 504 | + |
| 'E9 | Terminateur misc_feature | 1 608 | 1 898 | 291 | + |
| Pro-Ubq10At | Promoteur misc_feature | 1 924 | 3 399 | 1 476 | + |
| TATA | Site misc_feature | 2 995 | 2 998 | 4 | + |
| Ubi cds 5` | Séquence codante CDS | 3 028 | 3 091 | 64 | + |
| íntron | Séquence codante CDS | 3 094 | 3 397 | 304 | + |
| TATA | Site CDS | 3 159 | 3 162 | 4 | + |
| OCS | Terminateur misc_feature | 3 451 | 3 646 | 196 | + |
| Right Border Region | Autre misc_feature | 3 692 | 4 294 | 603 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 3 737 | 3 760 | 24 | + |
| 'ColE1'' | Origine / squelette misc_feature | 4 308 | 4 966 | 659 | + |
| ''pVS1 ORI''' | Origine / squelette misc_feature | 4 995 | 6 958 | 1 964 | + |
| ParB | Séquence codante CDS | 5 321 | 6 496 | 1 176 | + |
| strep/spec | Marqueur de sélection CDS | 7 147 | 8 157 | 1 011 | + |
| Left Border Region | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 8 225 | 163 | 0 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p9D35s-UbiAt (F566; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9D35s-UbiAt; RRID:SCR_029231)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.