p9DU10 C873
Vecteur binaire avec Ubq10–nptII, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 1 267 | dans Pro-Ubq10At |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 1 646 | entre Pro-Ubq10At et NptIIo' |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 2 203 | dans 'NptIIo' |
| FseIGGCCGG^CC | 2 313 | dans 'NptIIo' |
| MluIA^CGCGT | 2 657 | entre 'NptIIo' et E9 |
| PstICTGCA^G | 2 967 | entre E9 et Right Border Region |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2 967 | entre E9 et Right Border Region |
| NotIGC^GGCCGC | 2 976 | entre E9 et Right Border Region |
| SpeIA^CTAGT | 2 986 | entre E9 et Right Border Region |
| BamHIG^GATCC | 2 995 | entre E9 et Right Border Region |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 3 006 | entre E9 et Right Border Region |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 3 013 | entre E9 et Right Border Region |
| HindIIIA^AGCTT | 3 031 | entre E9 et Right Border Region |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3 082 | entre E9 et Right Border Region |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 3 114 | dans Right Border Region |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 3 239 | dans Right Border Region |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 3 505 | dans Right Border Region |
Double coupure : EcoRI (829, 3 022), SalI (1 007, 3 040), SacI (1 262, 2 174), BglII (1 574, 3 060), ApaI (1 747, 3 073), SfiI (2 975, 3 054), MfeI (14, 2 067), StuI (2 969, 3 048), EagI (2 976, 3 496), XmnI (430, 2 659), BstEII (2 416, 6 917), AarI (2 137, 2 258).
Aucun site : NcoI, NdeI, NheI, ClaI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, HpaI, NsiI, AflII, SacII, PvuII, BsmBI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- Ubq10
- Gène 1
- nptII
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- NptIIo', 'NptIIo', strep/spec
- Taille
- 7 767 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 25-APR-2018
Construction
- Pro-Ubq10At–NptIIo · E9 · cassette de sélection, 169–2 957
- MCS · 8 sites uniques · en 2 967, 3 031
- SfiI ×2 · encadre le MCS · en 2 975, 3 054
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of U10-BsmB-Xho* into C860p9D35s*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB' | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| Pro-Ubq10At | Promoteur misc_feature | 169 | 1 644 | 1 476 | + |
| Ubi cds 5` | Séquence codante CDS | 1 273 | 1 336 | 64 | + |
| íntron | Séquence codante CDS | 1 339 | 1 642 | 304 | + |
| NptIIo' | Marqueur de sélection CDS | 1 664 | 1 962 | 299 | + |
| 'intron | Séquence codante CDS | 1 963 | 2 149 | 187 | + |
| ''NptIIo' | Marqueur de sélection CDS | 2 150 | 2 653 | 504 | + |
| 'E9 | Terminateur misc_feature | 2 667 | 2 957 | 291 | + |
| Right Border Region | Autre misc_feature | 3 085 | 3 687 | 603 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 3 130 | 3 153 | 24 | + |
| 'ColE1'' | Origine / squelette misc_feature | 3 701 | 4 359 | 659 | + |
| ''pVS1 ORI''' | Origine / squelette misc_feature | 4 388 | 6 351 | 1 964 | + |
| ParB | Séquence codante CDS | 4 714 | 5 889 | 1 176 | + |
| strep/spec | Marqueur de sélection CDS | 6 540 | 7 550 | 1 011 | + |
| Left Border Region | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 7 618 | 163 | 0 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p9DU10 (C873; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9DU10)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.