p9oN-ocs-LH B403
Vecteur binaire avec Nos–nptII, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 303 | entre BL et Pnos |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 421 | dans Pnos |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 607 | entre Pnos et nptIIo |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 1 135 | dans nptIIo |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 1 620 | entre nptIIo et TE9 |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1 928 | entre TE9 et Tocs |
| NcoIC^CATGG | 1 954 | entre TE9 et Tocs |
| SpeIA^CTAGT | 1 967 | entre TE9 et Tocs |
| BamHIG^GATCC | 1 973 | entre TE9 et Tocs |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1 981 | entre TE9 et Tocs |
| EcoRIG^AATTC | 1 991 | entre TE9 et Tocs |
| HindIIIA^AGCTT | 1 997 | entre TE9 et Tocs |
| SalIG^TCGAC | 2 009 | entre TE9 et Tocs |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2 217 | entre Tocs et BR |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2 219 | entre Tocs et BR |
| BglIIA^GATCT | 2 229 | entre Tocs et BR |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2 246 | entre Tocs et BR |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 2 278 | entre Tocs et BR |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 2 669 | entre BR et ColE1 |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 2 790 | entre BR et ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 6 883 | dans pVS1 ORI |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 7 079 | dans pVS1 ORI |
Double coupure : PstI (1 928, 1 989), SphI (1 934, 2 403), NdeI (3 784, 5 543), NheI (503, 6 999), ApaI (708, 2 240), MluI (1 618, 2 003), SfiI (1 959, 2 223), MfeI (14, 1 028), AgeI (7 493, 7 801), BstEII (1 377, 8 364), SapI (3 722, 7 619), AarI (1 098, 1 219).
Aucun site : AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, NsiI, BsrGI, PvuII.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- Nos
- Gène 1
- nptII
- Gène 2
- MCS
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- nptIIo, Sm/Sp
- Taille
- 9 517 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 22-JAN-2016
Construction
- Pnos–nptIIo · TE9 · cassette de sélection, 309–1 918
- MCS · 8 sites uniques · en 1 928, 2 009
- SfiI ×2 · encadre le MCS · en 1 959, 2 223
Ligation of pOCS-BM* into B401p9oN-LH*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| BL | Site misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| Pnos | Promoteur misc_feature | 309 | 606 | 298 | + |
| nptIIo | Marqueur de sélection CDS | 625 | 923 | 299 | + |
| splice | Site misc_signal | 920 | 923 | 4 | + |
| int | Site CDS | 924 | 1 110 | 187 | + |
| splice | Site misc_signal | 1 109 | 1 112 | 4 | + |
| nptIIo | Marqueur de sélection CDS | 1 111 | 1 614 | 504 | + |
| TE9 | Terminateur misc_feature | 1 628 | 1 918 | 291 | + |
| Tocs | Terminateur misc_feature | 2 014 | 2 209 | 196 | + |
| BR | Site misc_feature | 2 294 | 2 317 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 2 852 | 3 549 | 698 | + |
| pVS1 ORI | Origine / squelette misc_feature | 4 098 | 7 803 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 7 987 | 8 997 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p9oN-ocs-LH (B403; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9oN-ocs-LH)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.