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DNA Cloning Service
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Binaires

p9oUH-LH-ocs B421

Vecteur binaire avec UbiHa–nptII, pour les dicotylédones.

123456789pVS1Sm/SpColE1nptIIoUbiZmnptIIoTE9bomTocsintmRNALBRBXhoI (653)SacI (1181)XmnI (1666)SbfI, NcoI, SpeI, BamHISmaI, EcoRI, HindIII, SalIStuI, BglII, KpnI, PmeIAatII, EcoRVBsiWI, NheI, ClaIB421p9oUH-LH-ocs9 563 bp

GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq

S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.

Sites de restriction

Enzyme à coupure unique · siteCoupe enEmplacement
XhoI (PaeR7I)C^TCGAG653entre UbiZm et nptIIo
SacI (Ecl136II)GAGCT^C1 181dans nptIIo
XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC1 666entre nptIIo et TE9
SbfI (SdaI)CCTGCA^GG1 974entre TE9 et Tocs
NcoIC^CATGG2 000entre TE9 et Tocs
SpeIA^CTAGT2 013entre TE9 et Tocs
BamHIG^GATCC2 019entre TE9 et Tocs
SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG2 027entre TE9 et Tocs
EcoRIG^AATTC2 037entre TE9 et Tocs
HindIIIA^AGCTT2 043entre TE9 et Tocs
SalIG^TCGAC2 055entre TE9 et Tocs
StuI (Eco147I)AGG^CCT2 263entre Tocs et RB
BglIIA^GATCT2 275entre Tocs et RB
KpnI (Acc65I)GGTAC^C2 292entre Tocs et RB
PmeI (MssI)GTTT^AAAC2 324entre Tocs et RB
AatII (ZraI)GACGT^C2 715entre RB et ColE1
EcoRV (Eco32I)GAT^ATC2 836entre RB et ColE1
BsiWI (Pfl23II)C^GTACG6 929dans pVS1
NheI (BmtI)G^CTAGC7 045dans pVS1
ClaI (BspDI)AT^CGAT7 125dans pVS1

Double coupure : XbaI (303, 384), PstI (1 974, 2 035), SphI (1 980, 2 449), NdeI (3 830, 5 589), ApaI (754, 2 286), MluI (1 664, 2 049), SfiI (2 005, 2 269), MfeI (14, 1 074), AgeI (7 539, 7 847), AflII (320, 2 265), BstEII (1 423, 8 410), SapI (3 768, 7 665), AarI (1 144, 1 265).

Aucun site : AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, NsiI, BsrGI, SacII, PvuII.

Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.

Promoteur 1
UbiHa
Gène 1
nptII
Gène 2
MCS
Caractéristiques
dicotylédones
Autres marqueurs
nptIIo, Sm/Sp
Taille
9 563 bp, circulaire
Date de l’enregistrement
22-JAN-2016

Construction

  • UbiZm–nptIIo · TE9 · cassette de sélection, 316–1 964
  • MCS · 8 sites uniques · en 1 974, 2 055
  • SfiI ×2 · encadre le MCS · en 2 005, 2 269
  • Bordures de l’ADN-T · LB, RB

Ligation of pOCS-BM* into B418p9oUH-LH*

Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.

300 €

CommanderDemander une variante

Éléments annotés

ÉlémentTypeDébutFinLongueurBrin
LBBordure de l’ADN-T misc_feature12424+
UbiZmPromoteur misc_feature316651336+
catSite misc_signal4334353+
catSite misc_signal4364383+
catSite misc_signal4694713+
catSite misc_signal4985003+
catSite misc_signal5095113+
catSite misc_signal5305323+
catSite misc_signal5335353+
tataSite misc_signal5385414+
mRNASéquence codante CDS56965183+
nptIIoMarqueur de sélection CDS671969299+
spliceSite misc_signal9669694+
intSite CDS9701 156187+
spliceSite misc_signal1 1551 1584+
nptIIoMarqueur de sélection CDS1 1571 660504+
TE9Terminateur misc_feature1 6741 964291+
TocsTerminateur misc_feature2 0602 255196+
RBBordure de l’ADN-T misc_feature2 3402 36324+
ColE1Origine / squelette misc_feature2 8983 595698+
bomOrigine / squelette misc_feature3 6323 891260+
pVS1Origine / squelette misc_feature4 1447 8493 706+
Sm/SpMarqueur de sélection CDS8 0339 0431 011+

PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite

Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.

Comment citer

Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.

p9oUH-LH-ocs (B421; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9oUH-LH-ocs; RRID:SCR_029231)

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