pB-35s-DoGus-ocs D748
Vecteur binaire avec 35s–oGus, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 303 | entre LB et 35S-Pro |
| NcoIC^CATGG | 311 | entre LB et 35S-Pro |
| SpeIA^CTAGT | 324 | entre LB et 35S-Pro |
| BamHIG^GATCC | 330 | entre LB et 35S-Pro |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 338 | entre LB et 35S-Pro |
| HindIIIA^AGCTT | 765 | entre 35S-Pro et ogus |
| MluIA^CGCGT | 771 | entre 35S-Pro et ogus |
| AarICACCTGC(4/8) | 1 579 | dans Intron |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 1 687 | dans ogus |
| SalIG^TCGAC | 2 789 | entre ogus et OCS |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2 999 | entre OCS et RB |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 3 020 | entre OCS et RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3 026 | entre OCS et RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 3 058 | entre OCS et RB |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 3 183 | entre RB et ColE1 |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 3 449 | entre RB et ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 7 663 | dans pVS1 ORI |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 7 779 | dans pVS1 ORI |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 7 859 | dans pVS1 ORI |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 9 144 | dans Sm/Sp |
Double coupure : NdeI (4 564, 6 323), BglII (1 790, 3 009), SfiI (316, 3 003), FseI (5 330, 7 435), MfeI (14, 1 509), AgeI (8 273, 8 581), StuI (2 293, 2 997), XmnI (630, 2 424), SapI (4 502, 8 399).
Aucun site : EcoRI, PstI, SacI, XhoI, AscI, PacI, SbfI, SwaI, AvrII, BstBI, NsiI, BsrGI, SacII, PvuII.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- 35s
- Gène 1
- oGus
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 10 297 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 19-AUG-2020
Construction
- 35S-Pro–ogus · OCS · cassette avec insert, 342–2 989
- MCS · 5 sites uniques · en 303, 338
- SfiI ×2 · encadre la cassette 35S-Pro–ogus · en 316, 3 003
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of B491p35s-DoGusi-ocs* into pB-BA*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| 35S-Pro | Promoteur misc_feature | 342 | 760 | 419 | + |
| TATA | Site CDS | 730 | 736 | 7 | + |
| ogus | Séquence codante CDS | 788 | 1 402 | 615 | + |
| 'Intron | Site misc_feature | 1 403 | 1 591 | 189 | + |
| ogus | Séquence codante CDS | 1 592 | 2 788 | 1 197 | + |
| OCS | Terminateur misc_feature | 2 794 | 2 989 | 196 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 3 074 | 3 097 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 3 632 | 4 329 | 698 | + |
| BOM | Origine / squelette misc_feature | 4 366 | 4 625 | 260 | + |
| pVS1 ORI | Origine / squelette misc_feature | 4 878 | 8 583 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection misc_feature | 8 767 | 9 777 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
pB-35s-DoGus-ocs (D748; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/pB-35s-DoGus-ocs)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.