pUC et expression chez E. coli
pAct-ocs2 E965
Vecteur de clonage pUC.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 79 | entre ColE1 et pAct |
| NcoIC^CATGG | 87 | entre ColE1 et pAct |
| NotIGC^GGCCGC | 93 | entre ColE1 et pAct |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 93 | entre ColE1 et pAct |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 108 | entre ColE1 et pAct |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 359 | dans pAct |
| FseIGGCCGG^CC | 873 | dans pAct |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 1 043 | dans mRNA |
| SpeIA^CTAGT | 1 508 | entre pAct et OCS |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1 523 | entre pAct et OCS |
| HindIIIA^AGCTT | 1 539 | entre pAct et OCS |
| MluIA^CGCGT | 1 545 | entre pAct et OCS |
| SalIG^TCGAC | 1 551 | entre pAct et OCS |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 1 754 | entre OCS et Amp |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 1 766 | entre OCS et Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 1 787 | entre OCS et Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 1 793 | entre OCS et Amp |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 2 760 | dans Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 4 365 | entre ColE1 et pAct |
Double coupure : EcoRI (489, 1 533), BamHI (1 206, 1 515), PstI (108, 1 531), SacI (77, 1 010), NdeI (123, 444), SfiI (92, 1 770), PvuI (1 945, 2 991), PvuII (1 914, 4 428), BsaI (1 102, 3 294), AarI (111, 800).
Aucun site : SphI, XhoI, NheI, ClaI, EcoRV, AscI, PacI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, MfeI, AgeI, BstBI, HpaI, StuI, SacII, AatII, BbsI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- Act
- Autres marqueurs
- Amp
- Taille
- 4 573 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 10-FEB-2022
Construction
- pAct–(vide)–OCS · cassette d’expression vide, 111–1 751
- MCS · 5 sites uniques · en 79, 108
- SfiI ×2 · encadre la cassette pAct–(empty)–OCS · en 92, 1 770
Ligation of actocs-Eag-Afl* into B627pAct-ocs* sequence corrected
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| pAct | Promoteur misc_feature | 111 | 1 508 | 1 398 | + |
| AT reich | Site CDS | 768 | 806 | 39 | + |
| mRNA | Séquence codante CDS | 954 | 1 508 | 555 | + |
| intron | Site CDS | 1 044 | 1 505 | 462 | + |
| OCS | Terminateur misc_feature | 1 556 | 1 751 | 196 | + |
| Amp | Marqueur de sélection misc_feature | 2 573 | 3 433 | 861 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 3 476 | 4 192 | 717 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
pAct-ocs2 (E965; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pAct-ocs2; RRID:SCR_029231)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.