pUC et expression chez E. coli
pENTK A249
Vecteur de clonage pUC.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 109 | entre ori pBR322 et attL1 |
| BbsI (BpiI)GAAGAC(2/6) | 435 | entre ori pBR322 et attL1 |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 499 | entre ori pBR322 et attL1 |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 552 | entre ori pBR322 et attL1 |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 565 | entre ori pBR322 et attL1 |
| SpeIA^CTAGT | 670 | entre attL1 et frame |
| BamHIG^GATCC | 677 | entre attL1 et frame |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 686 | entre attL1 et frame |
| PstICTGCA^G | 695 | entre attL1 et frame |
| EcoRIG^AATTC | 698 | entre attL1 et frame |
| HindIIIA^AGCTT | 705 | entre attL1 et frame |
| SalIG^TCGAC | 720 | entre attL1 et frame |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 840 | entre attL2 et Kan |
| PvuICGAT^CG | 1 422 | dans Kan |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 1 438 | dans Kan |
Double coupure : NheI (237, 503), NsiI (1 272, 1 538), BsrGI (649, 740), PvuII (172, 835).
Aucun site : XbaI, SphI, KpnI, SacI, NotI, XhoI, NcoI, NdeI, BglII, ClaI, AscI, PacI, SfiI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, MfeI, AgeI, BstBI, StuI, EagI, SacII, AatII, XmnI, BstEII, BsaI, AarI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Caractéristiques
- MCS adapté au clonage dans les vecteurs DCS
- Autres marqueurs
- Kan
- Taille
- 2 605 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 20-JUN-2013
Construction
- MCS · 7 sites uniques · en 670, 720
ENTK-Eco* Circularized
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| attL1 | Autre misc_feature | 567 | 666 | 100 | + |
| frame | Site misc_signal | 727 | 729 | 3 | + |
| attL2 | Autre misc_feature | 728 | 827 | 100 | + |
| Kan | Marqueur de sélection CDS | 997 | 1 806 | 810 | + |
| ori pBR322 | Origine / squelette misc_feature | 1 906 | 2 541 | 636 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
pENTK (A249; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pENTK; RRID:SCR_029231)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.